{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[448.3634604657036, 1013.805417297419, 1, 0, 0.3066427327817465, 0.002230333397287383, 0, -0.03210936088859052, 1, 0.3066427327817465, 0.0004740362202229867],
[448.2551608743989, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707269, 0, 0.0009863928610865324, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0004694087976911433],
[448.4010718733842, 1013.648936318218, 1, 0, 0.3066933889819596, 0.002230146319280815, 0, -0.03210666758935798, 1, 0.3066933889819596, 0.0004701143755726006],
[448.2847085408099, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066137998215872, 0.000474228366455406],
[448.2847085408099, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066137998215872, 0.0004753373683897117],
[448.4798237982778, 1013.595475571821, 1, 0, 0.3067419468692857, 0.002229754711217045, 0, -0.03210102973958101, 1, 0.3067419468692858, 0.0004727707938955593],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0004724592049997726],
[448.5093714646888, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067674627760828, 0, 0.0009866402626236667, 0.01420432850905965, 0.6932325372239172, 1, 0.0004727813399640025],
[448.3771253280602, 1013.672882863542, 0, 1, 0.3066770102362329, 0, 0.00098651154322594, 0.01420247537911953, 0.6933229897637672, 1, 0.000472538076624028],
[448.2847085408099, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066342604837902, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066342604837902, 0.0004725645117961261],
[448.3822661695438, 1013.638194355647, 0, 1, 0.3066867244856989, 0, 0.0009865453034114244, 0.01420296141317197, 0.6933132755143011, 1, 0.0004725909561742107],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0004711981580441755],
[448.3822661695438, 1013.672882863542, 0, 1, 0.3066794480810636, 0, 0.00098651154322594, 0.01420247537911953, 0.6933205519189364, 1, 0.0004739293789306128],
[448.4798237982777, 1013.570184393324, 1, 0, 0.3067472530252223, 0.002229754711217045, 0, -0.03210102973958101, 1, 0.3067472530252223, 0.0004747929802654898],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004726701026979331],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004739558411134107],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004726700922067833],
[448.4798237982777, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3067267861890935, 0.002229754711217045, 0, -0.03210102973958101, 1, 0.3067267861890935, 0.0004748345813158482],
[448.3048588778229, 1013.745149313779, 0, 1, 0.3066275820704161, 0, 0.0009864412181670283, 0.01420146293286425, 0.6933724179295839, 1, 0.0004726965050533587],
[448.3822661695438, 1013.611863691499, 0, 1, 0.3066922479450454, 0, 0.0009865709309656999, 0.01420333036446416, 0.6933077520549547, 1, 0.0004739823031871988],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.000472709164235306],
[448.2847085408099, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066137998215872, 0.0004727091570811155],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004727355690110127],
[448.7171250924438, 1013.332883099158, 0, 1, 0.3069095602601572, 0, 0.0009868425437272092, 0.01420724068217354, 0.6930904397398427, 1, 0.0004744958505205745],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004727354803270131],
[448.5474072466438, 1013.502600944958, 0, 1, 0.3067934781529454, 0, 0.0009866772902877915, 0.01420486158390474, 0.6932065218470547, 1, 0.0004744958447326406],
[448.3048588778229, 1013.745149313779, 0, 1, 0.3066275820704161, 0, 0.0009864412181670283, 0.01420146293286425, 0.6933724179295839, 1, 0.0004727354741640183],
[448.0474072466439, 1014.002600944958, 0, 1, 0.3064514925866525, 0, 0.000986190764272292, 0.01419785723225383, 0.6935485074133475, 1, 0.0004727354803270131],
[448.0474072466439, 1014.002600944958, 0, 1, 0.3064514925866525, 0, 0.000986190764272292, 0.01419785723225383, 0.6935485074133475, 1, 0.0004727618765906611],
[448.3822661695438, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067071904278807, 0, 0.0009866402626236667, 0.01420432850905965, 0.6932928095721193, 1, 0.0004727618766121989],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0003717796981100995],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006886079401345534],
[448.4798237982778, 1013.570184393324, 1, 0, 0.3067472530252224, 0.002229754711217045, 0, -0.03210102973958101, 1, 0.3067472530252224, 0.0003717615534824022],
[448.4391076553392, 1013.729770107784, 0, 1, 0.3066944690693848, 0, 0.0009864561833807801, 0.01420167838202074, 0.6933055309306152, 1, 0.0006885993309592689],
[447.187150912076, 1011.921952612348, 0, 0, 0.3064795838994576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002124361343622836],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215873, 0.0004759614585034642],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215873, 0.0006884117016254721],
[448.3634604657035, 1013.80541729742, 1, 0, 0.3066427327817465, 0.002230333397287384, 0, -0.03210936088859053, 1, 0.3066427327817465, 0.0006881147413775353],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006884519840979608],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0006885887054374723],
[447.187150912076, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3065205725001579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002658830890477608],
[448.2847085408099, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066342604837902, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066342604837902, 0.000422428132732461],
[447.187150912076, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3065205725001579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002722918738253201],
[448.28470854081, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066342604837902, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066342604837902, 0.0004161407203065757],
[447.3822661695438, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3066133060844515, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002809037027554225],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0004075044436611054],
[446.8192573501952, 1012.190450167381, 0, 0, 0.3062483101023594, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002939727862770204],
[448.1007617598695, 1013.899548428308, 1, 0, 0.3064984040271464, 0.002231640928421106, 0, -0.03212818497520324, 1, 0.3064984040271463, 0.0003944822356701316],
[446.7125483237439, 1012.65076579097, 0, 0, 0.3061009852743427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002819529324938782],
[448.0474072466438, 1014.129706240103, 0, 1, 0.3064248531275517, 0, 0.0009860671606864875, 0.01419607775293986, 0.6935751468724483, 1, 0.0004066799730023463],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006885347050109497],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215874, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215874, 0.000688649553086669],
[447.1401756403354, 1011.968927884089, 1, 0, 0.3064473894106238, 0.00223643513707515, 0, -0.03219720558711495, 1, 0.3064473894106239, 0.0006888682009327252],
[448.3099997193065, 1013.740008472295, 1, 0, 0.3066310982575881, 0.002230599363445193, 0, -0.0321131899140428, 1, 0.3066310982575882, 0.0006886918220105364],
[448.3099997193065, 1013.740008472295, 1, 0, 0.3066310982575881, 0.002230599363445193, 0, -0.0321131899140428, 1, 0.3066310982575882, 0.0006887245861118475],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215873, 0.0006885075791392248],
[448.2551608743989, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707269, 0, 0.0009863928610865324, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0006885075791392248],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.000688480453267458],
[448.2551608743989, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707269, 0, 0.0009863928610865324, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.000688426201523796],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0006883176980359665],
[448.4010718733841, 1013.530066746697, 1, 0, 0.3067183262110626, 0.002230146319280816, 0, -0.032106667589358, 1, 0.3067183262110627, 0.0006884712828635355],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0006885948017334014],
[448.2551608743988, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707268, 0, 0.0009863928610865322, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0006885460888107049],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006882196874382431],
[448.5093714646889, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067674627760829, 0, 0.000986640262623667, 0.01420432850905966, 0.6932325372239172, 1, 0.0006885143953051367],
[448.1195674637098, 1013.803335432747, 1, 0, 0.3065274964745857, 0.002231547275785906, 0, -0.03212683668966644, 1, 0.3065274964745857, 0.0006883162697172888],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0006884548268909467],
[449.0178595802328, 1013.502600944958, 0, 1, 0.3070164634954854, 0, 0.0009866772902877915, 0.01420486158390474, 0.6929835365045145, 1, 0.0006886820765464563],
[447.0895932833421, 1012.019510241082, 1, 0, 0.3064127228069606, 0.002236688160545603, 0, -0.032200848281044, 1, 0.3064127228069606, 0.0004657158775396796],
[447.28470854081, 1011.824394983614, 1, 0, 0.3065464449919545, 0.002235712468826241, 0, -0.03218680157503534, 1, 0.3065464449919545, 0.0006884257035417373],
[447.2166985784871, 1011.892404945937, 0, 1, 0.3064998343840442, 0, 0.0009882473621821756, 0.01422746538167736, 0.6935001656159558, 1, 0.0004672680719630807],
[447.187150912076, 1011.794847317203, 0, 1, 0.3065062841452554, 0, 0.0009883426493537922, 0.01422883719908601, 0.6934937158547445, 1, 0.0006889561926728392],
[447.1097436203551, 1011.999359904069, 0, 1, 0.3064265328345757, 0, 0.0009881429174963053, 0.01422596172661145, 0.6935734671654243, 1, 0.0006889657412366603],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215873, 0.0006884312972142752],
[448.5900197972987, 1013.362430765569, 0, 1, 0.3068430985047336, 0, 0.0009868137693288331, 0.01420682642682368, 0.6931569014952663, 1, 0.0006885766366616742],
[448.3099997193066, 1013.740008472295, 1, 0, 0.3066310982575881, 0.002230599363445193, 0, -0.0321131899140428, 1, 0.3066310982575881, 0.0006887433611549712],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006883772112377257],
[448.8048588778229, 1013.245149313779, 0, 1, 0.3069695676367091, 0, 0.0009869279913920642, 0.01420847084350783, 0.693030432363291, 1, 0.0006882936464051025],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006885407422687218],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0006883098751296539],
[447.3822661695438, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3066133060844515, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002803127652260873],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004079013070166573],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215874, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215874, 0.0006884626128474867],
[448.0474072466439, 1014.002600944958, 0, 1, 0.3064514925866525, 0, 0.000986190764272292, 0.01419785723225383, 0.6935485074133475, 1, 0.0006885197628003959],
[446.8568687578759, 1011.998024176258, 0, 0, 0.3063065908214704, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002875600524692798],
[448.1195674637098, 1013.803335432747, 1, 0, 0.3065274964745857, 0.002231547275785906, 0, -0.03212683668966644, 1, 0.3065274964745857, 0.0004007806453118989],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0003642799837652412],
[447.1364767598338, 1012.107967783359, 0, 1, 0.3064164324434396, 0, 0.0009880368812727786, 0.0142244351587124, 0.6935835675565605, 1, 0.001034236869043658],
[448.1745125417888, 1014.002600944958, 0, 2, 0.3065117819229572, 0, 0.001972381528544584, 0.02839571446450766, 0.480925908611672, 1, 0.001032851011698087],
[447.187150912076, 1011.921952612348, 0, 0, 0.3064795838994576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003117494663355845],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215874, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215874, 0.0003766731738063868],
[447.7977734250537, 1011.116214841903, 0, 0, 0.3069391184308217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003154453643432377],
[448.5900197972987, 1013.362430765569, 0, 1, 0.3068430985047336, 0, 0.0009868137693288331, 0.01420682642682368, 0.6931569014952663, 1, 0.0003729234493849432],
[448.0474072466439, 1014.002600944958, 0, 1, 0.3064514925866525, 0, 0.000986190764272292, 0.01419785723225383, 0.6935485074133475, 1, 0.0003732216645993467],
[448.8048588778229, 1013.245149313779, 0, 1, 0.3069695676367091, 0, 0.0009869279913920642, 0.01420847084350783, 0.693030432363291, 1, 0.000688358465970049],
[447.1880018003071, 1011.97652030071, 1, 0, 0.3064685270420441, 0.002236195953322005, 0, -0.03219376213894806, 1, 0.3064685270420442, 0.000688268049859711],
[447.1092498754135, 1011.977864933883, 1, 0, 0.3064308123465616, 0.002236589827382567, 0, -0.03219943261151985, 1, 0.3064308123465616, 0.000688258326527861],
[447.1280555792538, 1011.881651938322, 1, 0, 0.3064599592966502, 0.00223649575892638, 0, -0.03219807833954796, 1, 0.3064599592966502, 0.0006881817611495214],
[448.2551608743988, 1013.745149313779, 0, 1, 0.3066040121542127, 0, 0.0009864412181670283, 0.01420146293286425, 0.6933959878457873, 1, 0.0006882475135501508],
[448.2551608743988, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707268, 0, 0.0009863928610865322, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0006886687554110233],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0003631668056115547],
[448.2847085408099, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066137998215872, 0.0006886304033641002],
[447.187150912076, 1011.921952612348, 0, 0, 0.3064795838994576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003148119315104413],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215874, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215874, 0.000373568452549064],
[448.28470854081, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066342604837902, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066342604837902, 0.0006886302794028397],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0004749527065584878],
[447.1280555792538, 1011.98104794517, 0, 0, 0.3064390829302844, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003152288022042923],
[448.2551608743988, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707268, 0, 0.0009863928610865322, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0003732219379923407],
[447.3822661695438, 1011.47262676459, 0, 1, 0.3066667345302194, 0, 0.0009886575014874225, 0.01423337001951437, 0.6933332654697806, 1, 0.0006927338223612251],
[448.3822661695438, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067071904278807, 0, 0.0009866402626236667, 0.01420432850905965, 0.6932928095721193, 1, 0.0006887245632550577],
[448.5093714646889, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067674627760829, 0, 0.000986640262623667, 0.01420432850905966, 0.6932325372239172, 1, 0.0006882766179438104],
[447.3822661695438, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3066133060844515, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002207131901369229],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0004675050426856277],
[448.8048588778229, 1013.245149313779, 0, 1, 0.3069695676367091, 0, 0.0009869279913920642, 0.01420847084350783, 0.693030432363291, 1, 0.0006885103191001987],
[448.8048588778229, 1013.245149313779, 0, 1, 0.3069695676367091, 0, 0.0009869279913920642, 0.01420847084350783, 0.693030432363291, 1, 0.0006881905230182404],
[448.3771253280602, 1013.672882863542, 0, 1, 0.3066770102362328, 0, 0.00098651154322594, 0.01420247537911953, 0.6933229897637672, 1, 0.0006884546795840775],
[447.2377332690693, 1011.871370255355, 0, 0, 0.3065142505031208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000212488127427859],
[448.3099997193066, 1013.740008472295, 1, 0, 0.3066310982575881, 0.002230599363445193, 0, -0.0321131899140428, 1, 0.3066310982575881, 0.0004759032864794103],
[448.2551608743989, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707269, 0, 0.0009863928610865324, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0006884035617074017],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.000376838356120347],
[447.3822661695438, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3066133060844515, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003115110176370256],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0003769039551616183],
[447.187150912076, 1011.921952612348, 0, 0, 0.3064795838994576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002117077761570703],
[448.2847085408099, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066137998215872, 0.0004766707654460793],
[448.3822661695438, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067071904278807, 0, 0.0009866402626236667, 0.01420432850905965, 0.6932928095721193, 1, 0.0006885441957506763],
[448.5093714646888, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067674627760828, 0, 0.0009866402626236667, 0.01420432850905965, 0.6932325372239172, 1, 0.0006887915978729631],
[448.4118138359549, 1013.638194355647, 0, 1, 0.3067007361742653, 0, 0.0009865453034114244, 0.01420296141317197, 0.6932992638257347, 1, 0.0006882106353199316],
[448.2551608743989, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707268, 0, 0.0009863928610865322, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0006885123092855135],
[448.3822661695438, 1013.697289688469, 0, 1, 0.3066743286116283, 0, 0.0009864877909531763, 0.01420213342562548, 0.6933256713883718, 1, 0.0006883276634215902]
],
"NAMES": [
["Node1"],
["Node1233"],
["Node1230"],
["Node1227"],
["Node1224"],
["Node1221"],
["Node1218"],
["Node1215"],
["Node1212"],
["Node1209"],
["Node1206"],
["Node1203"],
["Node1197"],
["Node1194"],
["Node1191"],
["Node1188"],
["Node1185"],
["Node1182"],
["Node1179"],
["Node1176"],
["Node1173"],
["Node1170"],
["Node1164"],
["Node1161"],
["Node1155"],
["Node1152"],
["Node1149"],
["Node1146"],
["Node1143"],
["Node1140"],
["Node1084"],
["Node1029"],
["Node1054"],
["Node1057"],
["Node116"],
["Node115"],
["Node223"],
["Node365"],
["Node374"],
["Node605"],
["Node597"],
["Node596"],
["Node588"],
["Node587"],
["Node583"],
["Node582"],
["Node578"],
["Node577"],
["Node573"],
["Node572"],
["Node567"],
["Node564"],
["Node560"],
["Node559"],
["Node554"],
["Node551"],
["Node548"],
["Node545"],
["Node542"],
["Node539"],
["Node536"],
["Node533"],
["Node530"],
["Node527"],
["Node523"],
["Node520"],
["Node517"],
["Node514"],
["Node485"],
["Node481"],
["Node473"],
["Node490"],
["Node507"],
["Node414"],
["Node511"],
["Node620"],
["Node614"],
["Node617"],
["Node624"],
["Node627"],
["Node643"],
["Node642"],
["Node633"],
["Node638"],
["Node660"],
["Node659"],
["Node653"],
["Node666"],
["Node665"],
["Node675"],
["Node674"],
["Node686"],
["Node685"],
["Node691"],
["Node694"],
["Node713"],
["Node710"],
["Node707"],
["Node699"],
["Node737"],
["Node742"],
["Node762"],
["Node770"],
["Node769"],
["Node783"],
["Node790"],
["Node799"],
["Node798"],
["Node807"],
["Node804"],
["Node813"],
["Node821"],
["Node820"],
["Node847"],
["Node833"],
["Node842"],
["Node854"],
["Node853"],
["Node862"],
["Node894"],
["Node898"],
["Node897"],
["Node909"],
["Node908"],
["Node93"],
["Node100"],
["Node930"],
["Node937"],
["Node955"]
],
"RESOLVED": [
[448.3634604657036, 1013.805417297419, 1, 0, 0.3066427327817465, 0.002230333397287383, 0, -0.03210936088859052, 1, 0.3066427327817465, 0.0004740362202229867],
[448.2551608743989, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707269, 0, 0.0009863928610865324, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0004694087976911433],
[448.4010718733842, 1013.648936318218, 1, 0, 0.3066933889819596, 0.002230146319280815, 0, -0.03210666758935798, 1, 0.3066933889819596, 0.0004701143755726006],
[448.2847085408099, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066137998215872, 0.000474228366455406],
[448.2847085408099, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066137998215872, 0.0004753373683897117],
[448.4798237982778, 1013.595475571821, 1, 0, 0.3067419468692857, 0.002229754711217045, 0, -0.03210102973958101, 1, 0.3067419468692858, 0.0004727707938955593],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0004724592049997726],
[448.5093714646888, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067674627760828, 0, 0.0009866402626236667, 0.01420432850905965, 0.6932325372239172, 1, 0.0004727813399640025],
[448.3771253280602, 1013.672882863542, 0, 1, 0.3066770102362329, 0, 0.00098651154322594, 0.01420247537911953, 0.6933229897637672, 1, 0.000472538076624028],
[448.2847085408099, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066342604837902, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066342604837902, 0.0004725645117961261],
[448.3822661695438, 1013.638194355647, 0, 1, 0.3066867244856989, 0, 0.0009865453034114244, 0.01420296141317197, 0.6933132755143011, 1, 0.0004725909561742107],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0004711981580441755],
[448.3822661695438, 1013.672882863542, 0, 1, 0.3066794480810636, 0, 0.00098651154322594, 0.01420247537911953, 0.6933205519189364, 1, 0.0004739293789306128],
[448.4798237982777, 1013.570184393324, 1, 0, 0.3067472530252223, 0.002229754711217045, 0, -0.03210102973958101, 1, 0.3067472530252223, 0.0004747929802654898],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004726701026979331],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004739558411134107],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004726700922067833],
[448.4798237982777, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3067267861890935, 0.002229754711217045, 0, -0.03210102973958101, 1, 0.3067267861890935, 0.0004748345813158482],
[448.3048588778229, 1013.745149313779, 0, 1, 0.3066275820704161, 0, 0.0009864412181670283, 0.01420146293286425, 0.6933724179295839, 1, 0.0004726965050533587],
[448.3822661695438, 1013.611863691499, 0, 1, 0.3066922479450454, 0, 0.0009865709309656999, 0.01420333036446416, 0.6933077520549547, 1, 0.0004739823031871988],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.000472709164235306],
[448.2847085408099, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066137998215872, 0.0004727091570811155],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004727355690110127],
[448.7171250924438, 1013.332883099158, 0, 1, 0.3069095602601572, 0, 0.0009868425437272092, 0.01420724068217354, 0.6930904397398427, 1, 0.0004744958505205745],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004727354803270131],
[448.5474072466438, 1013.502600944958, 0, 1, 0.3067934781529454, 0, 0.0009866772902877915, 0.01420486158390474, 0.6932065218470547, 1, 0.0004744958447326406],
[448.3048588778229, 1013.745149313779, 0, 1, 0.3066275820704161, 0, 0.0009864412181670283, 0.01420146293286425, 0.6933724179295839, 1, 0.0004727354741640183],
[448.0474072466439, 1014.002600944958, 0, 1, 0.3064514925866525, 0, 0.000986190764272292, 0.01419785723225383, 0.6935485074133475, 1, 0.0004727354803270131],
[448.0474072466439, 1014.002600944958, 0, 1, 0.3064514925866525, 0, 0.000986190764272292, 0.01419785723225383, 0.6935485074133475, 1, 0.0004727618765906611],
[448.3822661695438, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067071904278807, 0, 0.0009866402626236667, 0.01420432850905965, 0.6932928095721193, 1, 0.0004727618766121989],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0003717796981100995],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006886079401345534],
[448.4798237982778, 1013.570184393324, 1, 0, 0.3067472530252224, 0.002229754711217045, 0, -0.03210102973958101, 1, 0.3067472530252224, 0.0003717615534824022],
[448.4391076553392, 1013.729770107784, 0, 1, 0.3066944690693848, 0, 0.0009864561833807801, 0.01420167838202074, 0.6933055309306152, 1, 0.0006885993309592689],
[447.187150912076, 1011.921952612348, 0, 0, 0.3064795838994576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002124361343622836],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215873, 0.0004759614585034642],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215873, 0.0006884117016254721],
[448.3634604657035, 1013.80541729742, 1, 0, 0.3066427327817465, 0.002230333397287384, 0, -0.03210936088859053, 1, 0.3066427327817465, 0.0006881147413775353],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006884519840979608],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0006885887054374723],
[447.187150912076, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3065205725001579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002658830890477608],
[448.2847085408099, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066342604837902, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066342604837902, 0.000422428132732461],
[447.187150912076, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3065205725001579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002722918738253201],
[448.28470854081, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066342604837902, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066342604837902, 0.0004161407203065757],
[447.3822661695438, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3066133060844515, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002809037027554225],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0004075044436611054],
[446.8192573501952, 1012.190450167381, 0, 0, 0.3062483101023594, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002939727862770204],
[448.1007617598695, 1013.899548428308, 1, 0, 0.3064984040271464, 0.002231640928421106, 0, -0.03212818497520324, 1, 0.3064984040271463, 0.0003944822356701316],
[446.7125483237439, 1012.65076579097, 0, 0, 0.3061009852743427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002819529324938782],
[448.0474072466438, 1014.129706240103, 0, 1, 0.3064248531275517, 0, 0.0009860671606864875, 0.01419607775293986, 0.6935751468724483, 1, 0.0004066799730023463],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006885347050109497],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215874, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215874, 0.000688649553086669],
[447.1401756403354, 1011.968927884089, 1, 0, 0.3064473894106238, 0.00223643513707515, 0, -0.03219720558711495, 1, 0.3064473894106239, 0.0006888682009327252],
[448.3099997193065, 1013.740008472295, 1, 0, 0.3066310982575881, 0.002230599363445193, 0, -0.0321131899140428, 1, 0.3066310982575882, 0.0006886918220105364],
[448.3099997193065, 1013.740008472295, 1, 0, 0.3066310982575881, 0.002230599363445193, 0, -0.0321131899140428, 1, 0.3066310982575882, 0.0006887245861118475],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215873, 0.0006885075791392248],
[448.2551608743989, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707269, 0, 0.0009863928610865324, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0006885075791392248],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.000688480453267458],
[448.2551608743989, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707269, 0, 0.0009863928610865324, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.000688426201523796],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0006883176980359665],
[448.4010718733841, 1013.530066746697, 1, 0, 0.3067183262110626, 0.002230146319280816, 0, -0.032106667589358, 1, 0.3067183262110627, 0.0006884712828635355],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0006885948017334014],
[448.2551608743988, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707268, 0, 0.0009863928610865322, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0006885460888107049],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006882196874382431],
[448.5093714646889, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067674627760829, 0, 0.000986640262623667, 0.01420432850905966, 0.6932325372239172, 1, 0.0006885143953051367],
[448.1195674637098, 1013.803335432747, 1, 0, 0.3065274964745857, 0.002231547275785906, 0, -0.03212683668966644, 1, 0.3065274964745857, 0.0006883162697172888],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0006884548268909467],
[449.0178595802328, 1013.502600944958, 0, 1, 0.3070164634954854, 0, 0.0009866772902877915, 0.01420486158390474, 0.6929835365045145, 1, 0.0006886820765464563],
[447.0895932833421, 1012.019510241082, 1, 0, 0.3064127228069606, 0.002236688160545603, 0, -0.032200848281044, 1, 0.3064127228069606, 0.0004657158775396796],
[447.28470854081, 1011.824394983614, 1, 0, 0.3065464449919545, 0.002235712468826241, 0, -0.03218680157503534, 1, 0.3065464449919545, 0.0006884257035417373],
[447.2166985784871, 1011.892404945937, 0, 1, 0.3064998343840442, 0, 0.0009882473621821756, 0.01422746538167736, 0.6935001656159558, 1, 0.0004672680719630807],
[447.187150912076, 1011.794847317203, 0, 1, 0.3065062841452554, 0, 0.0009883426493537922, 0.01422883719908601, 0.6934937158547445, 1, 0.0006889561926728392],
[447.1097436203551, 1011.999359904069, 0, 1, 0.3064265328345757, 0, 0.0009881429174963053, 0.01422596172661145, 0.6935734671654243, 1, 0.0006889657412366603],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215873, 0.0006884312972142752],
[448.5900197972987, 1013.362430765569, 0, 1, 0.3068430985047336, 0, 0.0009868137693288331, 0.01420682642682368, 0.6931569014952663, 1, 0.0006885766366616742],
[448.3099997193066, 1013.740008472295, 1, 0, 0.3066310982575881, 0.002230599363445193, 0, -0.0321131899140428, 1, 0.3066310982575881, 0.0006887433611549712],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006883772112377257],
[448.8048588778229, 1013.245149313779, 0, 1, 0.3069695676367091, 0, 0.0009869279913920642, 0.01420847084350783, 0.693030432363291, 1, 0.0006882936464051025],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0006885407422687218],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0006883098751296539],
[447.3822661695438, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3066133060844515, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002803127652260873],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0004079013070166573],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215874, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215874, 0.0006884626128474867],
[448.0474072466439, 1014.002600944958, 0, 1, 0.3064514925866525, 0, 0.000986190764272292, 0.01419785723225383, 0.6935485074133475, 1, 0.0006885197628003959],
[446.8568687578759, 1011.998024176258, 0, 0, 0.3063065908214704, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002875600524692798],
[448.1195674637098, 1013.803335432747, 1, 0, 0.3065274964745857, 0.002231547275785906, 0, -0.03212683668966644, 1, 0.3065274964745857, 0.0004007806453118989],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0003642799837652412],
[447.1364767598338, 1012.107967783359, 0, 1, 0.3064164324434396, 0, 0.0009880368812727786, 0.0142244351587124, 0.6935835675565605, 1, 0.001034236869043658],
[448.1745125417888, 1014.002600944958, 0, 2, 0.3065117819229572, 0, 0.001972381528544584, 0.02839571446450766, 0.480925908611672, 1, 0.001032851011698087],
[447.187150912076, 1011.921952612348, 0, 0, 0.3064795838994576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003117494663355845],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215874, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215874, 0.0003766731738063868],
[447.7977734250537, 1011.116214841903, 0, 0, 0.3069391184308217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003154453643432377],
[448.5900197972987, 1013.362430765569, 0, 1, 0.3068430985047336, 0, 0.0009868137693288331, 0.01420682642682368, 0.6931569014952663, 1, 0.0003729234493849432],
[448.0474072466439, 1014.002600944958, 0, 1, 0.3064514925866525, 0, 0.000986190764272292, 0.01419785723225383, 0.6935485074133475, 1, 0.0003732216645993467],
[448.8048588778229, 1013.245149313779, 0, 1, 0.3069695676367091, 0, 0.0009869279913920642, 0.01420847084350783, 0.693030432363291, 1, 0.000688358465970049],
[447.1880018003071, 1011.97652030071, 1, 0, 0.3064685270420441, 0.002236195953322005, 0, -0.03219376213894806, 1, 0.3064685270420442, 0.000688268049859711],
[447.1092498754135, 1011.977864933883, 1, 0, 0.3064308123465616, 0.002236589827382567, 0, -0.03219943261151985, 1, 0.3064308123465616, 0.000688258326527861],
[447.1280555792538, 1011.881651938322, 1, 0, 0.3064599592966502, 0.00223649575892638, 0, -0.03219807833954796, 1, 0.3064599592966502, 0.0006881817611495214],
[448.2551608743988, 1013.745149313779, 0, 1, 0.3066040121542127, 0, 0.0009864412181670283, 0.01420146293286425, 0.6933959878457873, 1, 0.0006882475135501508],
[448.2551608743988, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707268, 0, 0.0009863928610865322, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0006886687554110233],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0003631668056115547],
[448.2847085408099, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066137998215872, 0.0006886304033641002],
[447.187150912076, 1011.921952612348, 0, 0, 0.3064795838994576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003148119315104413],
[448.28470854081, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215874, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066137998215874, 0.000373568452549064],
[448.28470854081, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066342604837902, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537568, 1, 0.3066342604837902, 0.0006886302794028397],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0004749527065584878],
[447.1280555792538, 1011.98104794517, 0, 0, 0.3064390829302844, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003152288022042923],
[448.2551608743988, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707268, 0, 0.0009863928610865322, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0003732219379923407],
[447.3822661695438, 1011.47262676459, 0, 1, 0.3066667345302194, 0, 0.0009886575014874225, 0.01423337001951437, 0.6933332654697806, 1, 0.0006927338223612251],
[448.3822661695438, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067071904278807, 0, 0.0009866402626236667, 0.01420432850905965, 0.6932928095721193, 1, 0.0006887245632550577],
[448.5093714646889, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067674627760829, 0, 0.000986640262623667, 0.01420432850905966, 0.6932325372239172, 1, 0.0006882766179438104],
[447.3822661695438, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3066133060844515, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002207131901369229],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 1, 0, 0.3066805264234048, 0.002230239854360959, 0, -0.03210801418249412, 1, 0.3066805264234048, 0.0004675050426856277],
[448.8048588778229, 1013.245149313779, 0, 1, 0.3069695676367091, 0, 0.0009869279913920642, 0.01420847084350783, 0.693030432363291, 1, 0.0006885103191001987],
[448.8048588778229, 1013.245149313779, 0, 1, 0.3069695676367091, 0, 0.0009869279913920642, 0.01420847084350783, 0.693030432363291, 1, 0.0006881905230182404],
[448.3771253280602, 1013.672882863542, 0, 1, 0.3066770102362328, 0, 0.00098651154322594, 0.01420247537911953, 0.6933229897637672, 1, 0.0006884546795840775],
[447.2377332690693, 1011.871370255355, 0, 0, 0.3065142505031208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000212488127427859],
[448.3099997193066, 1013.740008472295, 1, 0, 0.3066310982575881, 0.002230599363445193, 0, -0.0321131899140428, 1, 0.3066310982575881, 0.0004759032864794103],
[448.2551608743989, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707269, 0, 0.0009863928610865324, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0006884035617074017],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.000376838356120347],
[447.3822661695438, 1011.72683735488, 0, 0, 0.3066133060844515, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003115110176370256],
[448.3822661695438, 1013.667742022058, 0, 1, 0.3066805264234048, 0, 0.0009865165463440774, 0.01420254740733111, 0.6933194735765952, 1, 0.0003769039551616183],
[447.187150912076, 1011.921952612348, 0, 0, 0.3064795838994576, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002117077761570703],
[448.2847085408099, 1013.765299650792, 1, 0, 0.3066137998215873, 0.002230725208662709, 0, -0.03211500166537569, 1, 0.3066137998215872, 0.0004766707654460793],
[448.3822661695438, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067071904278807, 0, 0.0009866402626236667, 0.01420432850905965, 0.6932928095721193, 1, 0.0006885441957506763],
[448.5093714646888, 1013.540636726913, 0, 1, 0.3067674627760828, 0, 0.0009866402626236667, 0.01420432850905965, 0.6932325372239172, 1, 0.0006887915978729631],
[448.4118138359549, 1013.638194355647, 0, 1, 0.3067007361742653, 0, 0.0009865453034114244, 0.01420296141317197, 0.6932992638257347, 1, 0.0006882106353199316],
[448.2551608743989, 1013.794847317203, 0, 1, 0.3065935900707268, 0, 0.0009863928610865322, 0.01420076675221653, 0.6934064099292732, 1, 0.0006885123092855135],
[448.3822661695438, 1013.697289688469, 0, 1, 0.3066743286116283, 0, 0.0009864877909531763, 0.01420213342562548, 0.6933256713883718, 1, 0.0006883276634215902]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6322337166044141, 2.13002714035327, 1, 0, 0.2288826976684409, 1.581693563213896, 0, -22.77111103576037, 1, 0.2288826976684409, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 1.426988894702905, 0, 0, 0.30698259961228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9399374558385784, 2.060062544161422, 1, 0, 0.3133124852795261, 1.063900575286508, 0, -15.31661928346752, 1, 0.3133124852795262, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.004186899732923908, 2.995813100267075, 0, 1, 0.00139563324430797, 0, 0.3337991945862212, 4.805594901787135, 0.9986043667556921, 1, 0.06946053535683706],
[0.9991410324802753, 2.000858967519724, 0, 1, 0.3330470108267585, 0, 0.4997853503086255, 7.195241841156228, 0.6669529891732415, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9411974236066238, 2.058802576393376, 0, 1, 0.3137324745355413, 0, 0.4857192289664833, 6.9927366161406, 0.6862675254644588, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9890017708561994, 2.010998229143801, 1, 0, 0.3296672569520665, 1.011120535339668, 0, -14.5567627739302, 1, 0.3296672569520664, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.650504195839197, 0, 0, 0.3772867070234468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9399374829085524, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3197134253272111, 1.063900544646426, 0, -15.31661884235256, 1, 0.3197134253272111, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -7.198332080675286, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7464534183783891, 2.154322714686743, 1, 0, 0.2573288610140494, 1.339668324076298, 0, -19.28675494932581, 1, 0.2573288610140494, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9399376552416147, 2.060062344758385, 1, 0, 0.3133125517472049, 1.063900349585363, 0, -15.31661603412393, 1, 0.3133125517472048, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7470488817572065, 2.252951118242793, 0, 1, 0.2490162939190689, 0, 0.4438622710908872, 6.390136050789845, 0.7509837060809311, 1, 0.06946053535683706],
[0.746756306651591, 2.253243693348408, 1, 0, 0.2489187688838637, 1.339124947580206, 0, -19.27893214039841, 1, 0.2489187688838638, 0.06946053535683706],
[0.9396394422287241, 2.060360557771276, 1, 0, 0.3132131474095747, 1.064237999235225, 0, -15.32147706273719, 1, 0.3132131474095747, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9305450950233877, 2.069454904976612, 2, 0, 0.3101816983411292, 2.149277891739071, 0, -30.94243199678298, 1, 0.09621268598578703, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 1.426988894702905, 0, 0, 0.30698259961228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.010281682967274, 0, 0, 0.318822519334155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.3452331801307613, 2.654766819869238, 0, 1, 0.1150777267102538, 0, 0.3766809169512129, 5.422948657336196, 0.8849222732897462, 1, 0.06946053535683706],
[1.393807317959941, 1.355887266145773, 0, 2, 0.5068953206718594, 0, 1.475048884915906, 21.23578341770894, 0.2431522247753084, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.93993771839697, 2.06006228160303, 1, 0, 0.31331257279899, 1.063900278100834, 0, -15.31661500498518, 1, 0.3133125727989901, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9875684137582633, 2.012431586241737, 1, 0, 0.3291894712527544, 1.012588075994075, 0, -14.57789046387482, 1, 0.3291894712527544, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.939555325418817, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3196249845322959, 1.064333278675462, 0, -15.32284876883977, 1, 0.3196249845322958, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.018397757719935, 0, 0, 0.2384853565263365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9994732238086828, 2.000526776191316, 0, 1, 0.333157741269561, 0, 0.4998683406296817, 7.196436624937116, 0.666842258730439, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[4.852340305296004, 9.417929945284127, 0, 0, 0.3400314233781761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01186884762903818],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6326699380820585, 2.130769336332393, 0, 1, 0.2289429494397396, 0, 0.4693140561714952, 6.756556852902231, 0.7710570505602603, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999798965558641, 0, 1, 0.3333556719904308, 0, 0.5000502636627034, 7.199055709746744, 0.6666443280095693, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7463115504540447, 2.253688449545955, 1, 0, 0.248770516818015, 1.339922984431388, 0, -19.29042120893326, 1, 0.248770516818015, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.940904667177832, 1.059095332822168, 0, 0, 0.6469682223926108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.389377487022291, 0, 0, 0.3252485861749637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999650269993681, 2.000034973000631, 1, 1, 0.3333216756664561, 1.000034974223786, 0.4999912569027284, -7.198961464264577, 0.8888966605309059, 0.5555400118638181, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987402956593957, 2.001259704340604, 1, 1, 0.3329134318864653, 1.001261293197119, 0.4996852721468704, -7.221021526446937, 0.8891686468695759, 0.5549955106425064, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987402542309712, 2.001259745769028, 0, 1, 0.3329134180769905, 0, 0.4996852618027992, 7.193800900551434, 0.6670865819230095, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9977208852196423, 2.002279114780357, 0, 1, 0.3325736284065475, 0, 0.4994308698613662, 7.190138505205269, 0.6674263715934525, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7470493168641565, 2.252950683135843, 0, 1, 0.2490164389547189, 0, 0.4438623568129407, 6.390137284901461, 0.7509835610452811, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987401053187036, 2.001259894681295, 0, 1, 0.332913368439568, 0, 0.4996852246215887, 7.193800365266034, 0.667086631560432, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.018397757719935, 0, 0, 0.2384853565263365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7248358455808359, 2.273985956094342, 1, 0, 0.2417068747385837, 1.379622718849763, 0, -19.86196495264941, 1, 0.2417068747385837, 0.06946053535683706],
[0.9394999210362648, 2.060500078963735, 1, 0, 0.3131666403454216, 1.064396044756453, 0, -15.32375239102852, 1, 0.3131666403454216, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7621325166746551, 2.000939570459905, 1, 0, 0.2758279525978721, 1.312107774069542, 0, -18.88997496677645, 1, 0.2758279525978722, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9394956791392534, 2.060504320860747, 1, 0, 0.3131652263797511, 1.064400850588455, 0, -15.32382157897788, 1, 0.3131652263797511, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.650504195839197, 0, 0, 0.3772867070234468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9399377899020062, 2.060062210097994, 1, 0, 0.3133125966340021, 1.063900197165448, 0, -15.31661383978561, 1, 0.3133125966340021, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987400966630455, 2.001259903336953, 0, 1, 0.3329133655543486, 0, 0.4996852224603979, 7.193800334152096, 0.6670866344456514, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9966807485001051, 2.003319251499894, 0, 1, 0.3322269161667018, 0, 0.4991715620220269, 7.186405337327897, 0.6677730838332983, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.940904667177832, 1.059095332822168, 0, 0, 0.6469682223926108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.389377487022291, 0, 0, 0.3252485861749637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9887810457288235, 2.011218954271177, 1, 0, 0.3295936819096079, 1.011346247300793, 0, -14.56001227323172, 1, 0.3295936819096079, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9982007537953942, 2.001799246204605, 0, 1, 0.3327335845984648, 0, 0.4995505927459967, 7.191862115367723, 0.6672664154015352, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.010281682967274, 0, 0, 0.318822519334155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7246494492770704, 2.275350550722928, 0, 0, 0.2415498164256903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.252949874694265, 0, 1, 0.2487009836395859, 0, 0.4438625160871386, 6.390139577918598, 0.7512990163604141, 1, 0.06946053535683706],
[0.9911841943829448, 2.005368837202066, 0, 1, 0.3307747882101266, 0, 0.498661384104892, 7.179060477192368, 0.6692252117898734, 1, 0.06946053535683706],
[0.6708459504779657, 1.979658245361231, 0, 1, 0.2531012595758461, 0, 0.5051376935100881, 7.272297728703972, 0.7468987404241538, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.252950628604239, 0, 1, 0.2487009211139418, 0, 0.4438623675564191, 6.390137439571711, 0.7512990788860582, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.414948234300628, 1.333142196322556, 1, 0, 0.5148841604822154, 0.7067396359516107, 0, -10.1746931883105, 1, 0.5148841604822154, 0.06946053535683706],
[1.940904667177832, 1.059095332822168, 0, 0, 0.6469682223926108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9399374827344483, 2.060062517265552, 1, 0, 0.3133124942448161, 1.063900544843492, 0, -15.31661884518964, 1, 0.3133124942448161, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.004187527127906068, 2.995812472872093, 0, 1, 0.00139584237596869, 0, 0.3337992644917783, 4.805595908193963, 0.9986041576240313, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9404395152298274, 2.059560484770173, 1, 1, 0.3134798384099425, 1.063332605452693, 0.4855404866206638, -8.318279089899882, 0.9017303909104765, 0.5286900677303612, 0.06946053535683706],
[0.9992322119050241, 2.000767788094975, 0, 1, 0.3330774039683415, 0, 0.4998081266352989, 7.195569744282173, 0.6669225960316585, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.00205950463121, 1.937878053618809, 0, 1, 0.3408438052771707, 0, 0.516028342512364, 7.429086744888885, 0.6591561947228293, 1, 0.06946053535683706],
[0.9389863919614305, 2.06101360803857, 2, 0, 0.3129954639871435, 2.129956320050857, 0, -30.66426581811831, 1, 0.09796616047652718, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9395644970533504, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3196271073470848, 1.064322889100415, 0, -15.32269919361703, 1, 0.3196271073470849, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9977210124721083, 2.002278987527891, 0, 1, 0.3325736708240362, 0, 0.4994309016021027, 7.190138962165993, 0.6674263291759638, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9981633745865548, 2.001836625413445, 0, 1, 0.332721124862185, 0, 0.499541264908902, 7.191727825629719, 0.6672788751378149, 1, 0.06946053535683706],
[0.9994731803812414, 2.000526819618758, 0, 1, 0.3331577267937472, 0, 0.4998683297785386, 7.196436468716852, 0.6668422732062528, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.410828205361173, 1.336737271849147, 0, 1, 0.5134830150776338, 0, 0.7480901603174956, 10.77000280050189, 0.4865169849223662, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.253345486997141, 0, 1, 0.2486681777898145, 0, 0.4437845886351953, 6.389017682564019, 0.7513318222101855, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 1.426988894702905, 0, 0, 0.30698259961228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987398103834934, 2.001260189616505, 0, 1, 0.3329132701278313, 0, 0.4996851509806062, 7.19379930508154, 0.6670867298721688, 1, 0.06946053535683706],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9402370537442405, 2.059762946255759, 1, 0, 0.3134123512480802, 1.063561573134955, 0, -15.31173878334164, 1, 0.3134123512480802, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3325696282112228, 2.667430371788776, 0, 1, 0.1108565427370743, 0, 0.374892634715485, 5.397203358562712, 0.8891434572629257, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9897183170327258, 2.010281682967274, 0, 0, 0.3299061056775753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9402386113423561, 2.059761388657644, 1, 0, 0.313412870447452, 1.063559811240175, 0, -15.31171341793419, 1, 0.313412870447452, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7470498241149863, 2.252950175885013, 0, 1, 0.2490166080383288, 0, 0.4438624567483726, 6.390138723638311, 0.7509833919616712, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.000327882183384, 0, 2, 0.3199014873482821, 0, 0.9998360857805842, 14.39430434338237, 0.4625339869110789, 1, 0.06946053535683706],
[1.940904667177832, 1.059095332822168, 0, 0, 0.6469682223926108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.129773118295882, 0, 1, 0.2288682128266743, 0, 0.4695335814925398, 6.759717285224223, 0.7711317871733258, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.936923157982993, 1.062373929200021, 1, 0, 0.6457923645710538, 0.5162827424921421, 0, -7.432749255960405, 1, 0.6457923645710538, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.010281682967274, 0, 0, 0.318822519334155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.004188845348397177, 2.995811154651602, 0, 1, 0.00139628178279906, 0, 0.3337994113705392, 4.805598022758156, 0.998603718217201, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.938301465340555, 1.060438990053777, 1, 0, 0.6463718665127589, 0.5159156188453391, 0, -7.427463900111692, 1, 0.6463718665127589, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7466545486186946, 2.253345451381305, 0, 1, 0.2488848495395649, 0, 0.4437845956495478, 6.389017783547296, 0.7511151504604351, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.937213825136432, 1.061000381646519, 2, 0, 0.6461225554711247, 1.032410554812733, 0, -14.86326803427252, 0.9999999999999998, 0.4174743566885368, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987400348501543, 2.001259965149845, 0, 1, 0.3329133449500515, 0, 0.4996852070266267, 7.193800111957274, 0.6670866550499485, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6760195794053521, 1.387740158727654, 0, 1, 0.3275669967362179, 0, 0.7205959946542497, 10.3741785310516, 0.6724330032637822, 1, 0.06946053535683706],
[0.7464563169769372, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2717888911477654, 1.339663121949166, 0, -19.28668005604857, 1, 0.2717888911477654, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.650504195839197, 0, 0, 0.3772867070234468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.00418792148529706, 2.995812078514702, 0, 1, 0.001395973828432354, 0, 0.3337993084318531, 4.805596540784464, 0.9986040261715676, 1, 0.06946053535683706],
[0.7467560852262981, 2.253243914773702, 1, 0, 0.2489186950754327, 1.339125344652476, 0, -19.27893785691452, 1, 0.2489186950754327, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9402409482335746, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3197836384118277, 1.063557167850107, 0, -15.31167536193515, 1, 0.3197836384118277, 0.06946053535683706],
[0.7620745571837482, 2.001363887940292, 1, 0, 0.2757704115061414, 1.312207566272134, 0, -18.89141164160307, 1, 0.2757704115061415, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7464562585480783, 2.249748193211067, 1, 1, 0.2491339528281575, 1.339663226811288, 0.4444941896242616, -12.88744799602116, 0.9379322735482176, 0.4362001792045322, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.00300236725811, 1.936492438472512, 0, 1, 0.341215900535946, 0, 0.5163975753960552, 7.434402466712715, 0.6587840994640539, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.389377487022291, 0, 0, 0.3252485861749637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.389377487022291, 0, 0, 0.3252485861749637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999490468025009, 2.000050953197498, 0, 2, 0.3333163489341671, 0, 0.9999745240502915, 14.39629739265842, 0.4444670905984693, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9890017513227231, 2.010998248677277, 1, 0, 0.3296672504409077, 1.011120555310006, 0, -14.55676306143644, 1, 0.3296672504409077, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 1.426988894702905, 0, 0, 0.30698259961228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706]
],
"RESOLVED": [
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6322337166044141, 2.13002714035327, 1, 0, 0.2288826976684409, 1.581693563213896, 0, -22.77111103576037, 1, 0.2288826976684409, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 1.426988894702905, 0, 0, 0.30698259961228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9399374558385784, 2.060062544161422, 1, 0, 0.3133124852795261, 1.063900575286508, 0, -15.31661928346752, 1, 0.3133124852795262, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.004186899732923908, 2.995813100267075, 0, 1, 0.00139563324430797, 0, 0.3337991945862212, 4.805594901787135, 0.9986043667556921, 1, 0.06946053535683706],
[0.9991410324802753, 2.000858967519724, 0, 1, 0.3330470108267585, 0, 0.4997853503086255, 7.195241841156228, 0.6669529891732415, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9411974236066238, 2.058802576393376, 0, 1, 0.3137324745355413, 0, 0.4857192289664833, 6.9927366161406, 0.6862675254644588, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9890017708561994, 2.010998229143801, 1, 0, 0.3296672569520665, 1.011120535339668, 0, -14.5567627739302, 1, 0.3296672569520664, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.650504195839197, 0, 0, 0.3772867070234468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9399374829085524, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3197134253272111, 1.063900544646426, 0, -15.31661884235256, 1, 0.3197134253272111, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -7.198332080675286, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7464534183783891, 2.154322714686743, 1, 0, 0.2573288610140494, 1.339668324076298, 0, -19.28675494932581, 1, 0.2573288610140494, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9399376552416147, 2.060062344758385, 1, 0, 0.3133125517472049, 1.063900349585363, 0, -15.31661603412393, 1, 0.3133125517472048, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7470488817572065, 2.252951118242793, 0, 1, 0.2490162939190689, 0, 0.4438622710908872, 6.390136050789845, 0.7509837060809311, 1, 0.06946053535683706],
[0.746756306651591, 2.253243693348408, 1, 0, 0.2489187688838637, 1.339124947580206, 0, -19.27893214039841, 1, 0.2489187688838638, 0.06946053535683706],
[0.9396394422287241, 2.060360557771276, 1, 0, 0.3132131474095747, 1.064237999235225, 0, -15.32147706273719, 1, 0.3132131474095747, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9305450950233877, 2.069454904976612, 2, 0, 0.3101816983411292, 2.149277891739071, 0, -30.94243199678298, 1, 0.09621268598578703, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 1.426988894702905, 0, 0, 0.30698259961228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.010281682967274, 0, 0, 0.318822519334155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.3452331801307613, 2.654766819869238, 0, 1, 0.1150777267102538, 0, 0.3766809169512129, 5.422948657336196, 0.8849222732897462, 1, 0.06946053535683706],
[1.393807317959941, 1.355887266145773, 0, 2, 0.5068953206718594, 0, 1.475048884915906, 21.23578341770894, 0.2431522247753084, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.93993771839697, 2.06006228160303, 1, 0, 0.31331257279899, 1.063900278100834, 0, -15.31661500498518, 1, 0.3133125727989901, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9875684137582633, 2.012431586241737, 1, 0, 0.3291894712527544, 1.012588075994075, 0, -14.57789046387482, 1, 0.3291894712527544, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.939555325418817, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3196249845322959, 1.064333278675462, 0, -15.32284876883977, 1, 0.3196249845322958, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.018397757719935, 0, 0, 0.2384853565263365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9994732238086828, 2.000526776191316, 0, 1, 0.333157741269561, 0, 0.4998683406296817, 7.196436624937116, 0.666842258730439, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[4.852340305296004, 9.417929945284127, 0, 0, 0.3400314233781761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01186884762903818],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6326699380820585, 2.130769336332393, 0, 1, 0.2289429494397396, 0, 0.4693140561714952, 6.756556852902231, 0.7710570505602603, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999798965558641, 0, 1, 0.3333556719904308, 0, 0.5000502636627034, 7.199055709746744, 0.6666443280095693, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7463115504540447, 2.253688449545955, 1, 0, 0.248770516818015, 1.339922984431388, 0, -19.29042120893326, 1, 0.248770516818015, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.940904667177832, 1.059095332822168, 0, 0, 0.6469682223926108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.389377487022291, 0, 0, 0.3252485861749637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999650269993681, 2.000034973000631, 1, 1, 0.3333216756664561, 1.000034974223786, 0.4999912569027284, -7.198961464264577, 0.8888966605309059, 0.5555400118638181, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987402956593957, 2.001259704340604, 1, 1, 0.3329134318864653, 1.001261293197119, 0.4996852721468704, -7.221021526446937, 0.8891686468695759, 0.5549955106425064, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987402542309712, 2.001259745769028, 0, 1, 0.3329134180769905, 0, 0.4996852618027992, 7.193800900551434, 0.6670865819230095, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9977208852196423, 2.002279114780357, 0, 1, 0.3325736284065475, 0, 0.4994308698613662, 7.190138505205269, 0.6674263715934525, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7470493168641565, 2.252950683135843, 0, 1, 0.2490164389547189, 0, 0.4438623568129407, 6.390137284901461, 0.7509835610452811, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987401053187036, 2.001259894681295, 0, 1, 0.332913368439568, 0, 0.4996852246215887, 7.193800365266034, 0.667086631560432, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.018397757719935, 0, 0, 0.2384853565263365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7248358455808359, 2.273985956094342, 1, 0, 0.2417068747385837, 1.379622718849763, 0, -19.86196495264941, 1, 0.2417068747385837, 0.06946053535683706],
[0.9394999210362648, 2.060500078963735, 1, 0, 0.3131666403454216, 1.064396044756453, 0, -15.32375239102852, 1, 0.3131666403454216, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7621325166746551, 2.000939570459905, 1, 0, 0.2758279525978721, 1.312107774069542, 0, -18.88997496677645, 1, 0.2758279525978722, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9394956791392534, 2.060504320860747, 1, 0, 0.3131652263797511, 1.064400850588455, 0, -15.32382157897788, 1, 0.3131652263797511, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.650504195839197, 0, 0, 0.3772867070234468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9399377899020062, 2.060062210097994, 1, 0, 0.3133125966340021, 1.063900197165448, 0, -15.31661383978561, 1, 0.3133125966340021, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987400966630455, 2.001259903336953, 0, 1, 0.3329133655543486, 0, 0.4996852224603979, 7.193800334152096, 0.6670866344456514, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9966807485001051, 2.003319251499894, 0, 1, 0.3322269161667018, 0, 0.4991715620220269, 7.186405337327897, 0.6677730838332983, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.940904667177832, 1.059095332822168, 0, 0, 0.6469682223926108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.389377487022291, 0, 0, 0.3252485861749637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3302821542001235, 2.669717845799875, 0, 0, 0.1100940514000412, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9887810457288235, 2.011218954271177, 1, 0, 0.3295936819096079, 1.011346247300793, 0, -14.56001227323172, 1, 0.3295936819096079, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9982007537953942, 2.001799246204605, 0, 1, 0.3327335845984648, 0, 0.4995505927459967, 7.191862115367723, 0.6672664154015352, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.010281682967274, 0, 0, 0.318822519334155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7246494492770704, 2.275350550722928, 0, 0, 0.2415498164256903, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.252949874694265, 0, 1, 0.2487009836395859, 0, 0.4438625160871386, 6.390139577918598, 0.7512990163604141, 1, 0.06946053535683706],
[0.9911841943829448, 2.005368837202066, 0, 1, 0.3307747882101266, 0, 0.498661384104892, 7.179060477192368, 0.6692252117898734, 1, 0.06946053535683706],
[0.6708459504779657, 1.979658245361231, 0, 1, 0.2531012595758461, 0, 0.5051376935100881, 7.272297728703972, 0.7468987404241538, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.252950628604239, 0, 1, 0.2487009211139418, 0, 0.4438623675564191, 6.390137439571711, 0.7512990788860582, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.414948234300628, 1.333142196322556, 1, 0, 0.5148841604822154, 0.7067396359516107, 0, -10.1746931883105, 1, 0.5148841604822154, 0.06946053535683706],
[1.940904667177832, 1.059095332822168, 0, 0, 0.6469682223926108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9399374827344483, 2.060062517265552, 1, 0, 0.3133124942448161, 1.063900544843492, 0, -15.31661884518964, 1, 0.3133124942448161, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.004187527127906068, 2.995812472872093, 0, 1, 0.00139584237596869, 0, 0.3337992644917783, 4.805595908193963, 0.9986041576240313, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9404395152298274, 2.059560484770173, 1, 1, 0.3134798384099425, 1.063332605452693, 0.4855404866206638, -8.318279089899882, 0.9017303909104765, 0.5286900677303612, 0.06946053535683706],
[0.9992322119050241, 2.000767788094975, 0, 1, 0.3330774039683415, 0, 0.4998081266352989, 7.195569744282173, 0.6669225960316585, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.00205950463121, 1.937878053618809, 0, 1, 0.3408438052771707, 0, 0.516028342512364, 7.429086744888885, 0.6591561947228293, 1, 0.06946053535683706],
[0.9389863919614305, 2.06101360803857, 2, 0, 0.3129954639871435, 2.129956320050857, 0, -30.66426581811831, 1, 0.09796616047652718, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9395644970533504, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3196271073470848, 1.064322889100415, 0, -15.32269919361703, 1, 0.3196271073470849, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9977210124721083, 2.002278987527891, 0, 1, 0.3325736708240362, 0, 0.4994309016021027, 7.190138962165993, 0.6674263291759638, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9981633745865548, 2.001836625413445, 0, 1, 0.332721124862185, 0, 0.499541264908902, 7.191727825629719, 0.6672788751378149, 1, 0.06946053535683706],
[0.9994731803812414, 2.000526819618758, 0, 1, 0.3331577267937472, 0, 0.4998683297785386, 7.196436468716852, 0.6668422732062528, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.410828205361173, 1.336737271849147, 0, 1, 0.5134830150776338, 0, 0.7480901603174956, 10.77000280050189, 0.4865169849223662, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.253345486997141, 0, 1, 0.2486681777898145, 0, 0.4437845886351953, 6.389017682564019, 0.7513318222101855, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 1.426988894702905, 0, 0, 0.30698259961228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987398103834934, 2.001260189616505, 0, 1, 0.3329132701278313, 0, 0.4996851509806062, 7.19379930508154, 0.6670867298721688, 1, 0.06946053535683706],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9402370537442405, 2.059762946255759, 1, 0, 0.3134123512480802, 1.063561573134955, 0, -15.31173878334164, 1, 0.3134123512480802, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.3325696282112228, 2.667430371788776, 0, 1, 0.1108565427370743, 0, 0.374892634715485, 5.397203358562712, 0.8891434572629257, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9897183170327258, 2.010281682967274, 0, 0, 0.3299061056775753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.8451854165582123, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2817284721860708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0, 1.735787123761476, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9402386113423561, 2.059761388657644, 1, 0, 0.313412870447452, 1.063559811240175, 0, -15.31171341793419, 1, 0.313412870447452, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7470498241149863, 2.252950175885013, 0, 1, 0.2490166080383288, 0, 0.4438624567483726, 6.390138723638311, 0.7509833919616712, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.000327882183384, 0, 2, 0.3199014873482821, 0, 0.9998360857805842, 14.39430434338237, 0.4625339869110789, 1, 0.06946053535683706],
[1.940904667177832, 1.059095332822168, 0, 0, 0.6469682223926108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.129773118295882, 0, 1, 0.2288682128266743, 0, 0.4695335814925398, 6.759717285224223, 0.7711317871733258, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.936923157982993, 1.062373929200021, 1, 0, 0.6457923645710538, 0.5162827424921421, 0, -7.432749255960405, 1, 0.6457923645710538, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.010281682967274, 0, 0, 0.318822519334155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 2.092543011157808, 0, 0, 0.2424527879446889, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.004188845348397177, 2.995811154651602, 0, 1, 0.00139628178279906, 0, 0.3337994113705392, 4.805598022758156, 0.998603718217201, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.938301465340555, 1.060438990053777, 1, 0, 0.6463718665127589, 0.5159156188453391, 0, -7.427463900111692, 1, 0.6463718665127589, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7466545486186946, 2.253345451381305, 0, 1, 0.2488848495395649, 0, 0.4437845956495478, 6.389017783547296, 0.7511151504604351, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.937213825136432, 1.061000381646519, 2, 0, 0.6461225554711247, 1.032410554812733, 0, -14.86326803427252, 0.9999999999999998, 0.4174743566885368, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9987400348501543, 2.001259965149845, 0, 1, 0.3329133449500515, 0, 0.4996852070266267, 7.193800111957274, 0.6670866550499485, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6760195794053521, 1.387740158727654, 0, 1, 0.3275669967362179, 0, 0.7205959946542497, 10.3741785310516, 0.6724330032637822, 1, 0.06946053535683706],
[0.7464563169769372, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2717888911477654, 1.339663121949166, 0, -19.28668005604857, 1, 0.2717888911477654, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7622608569576849, 2, 0, 0, 0.2759554207335901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.415507255509889, 1.330282154200123, 0, 0, 0.5155192348343216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2716120205987596, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.650504195839197, 0, 0, 0.3772867070234468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.00418792148529706, 2.995812078514702, 0, 1, 0.001395973828432354, 0, 0.3337993084318531, 4.805596540784464, 0.9986040261715676, 1, 0.06946053535683706],
[0.7467560852262981, 2.253243914773702, 1, 0, 0.2489186950754327, 1.339125344652476, 0, -19.27893785691452, 1, 0.2489186950754327, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9402409482335746, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3197836384118277, 1.063557167850107, 0, -15.31167536193515, 1, 0.3197836384118277, 0.06946053535683706],
[0.7620745571837482, 2.001363887940292, 1, 0, 0.2757704115061414, 1.312207566272134, 0, -18.89141164160307, 1, 0.2757704115061415, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.98078635003932, 0, 0, 0.252675640676672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.154814583441787, 0, 0, 0.2571152116837693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7464562585480783, 2.249748193211067, 1, 1, 0.2491339528281575, 1.339663226811288, 0.4444941896242616, -12.88744799602116, 0.9379322735482176, 0.4362001792045322, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 7.198332080675286, 0.6666666666666667, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 2.130154418838422, 0, 0, 0.228836620019825, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 2.059095332822167, 0, 0, 0.3136348890592776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.00300236725811, 1.936492438472512, 0, 1, 0.341215900535946, 0, 0.5163975753960552, 7.434402466712715, 0.6587840994640539, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.7457894097100113, 2.254210590289988, 0, 0, 0.2485964699033372, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9409046671778326, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3199371532436477, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.389377487022291, 0, 0, 0.3252485861749637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6697178457998761, 1.389377487022291, 0, 0, 0.3252485861749637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999490468025009, 2.000050953197498, 0, 2, 0.3333163489341671, 0, 0.9999745240502915, 14.39629739265842, 0.4444670905984693, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9890017513227231, 2.010998248677277, 1, 0, 0.3296672504409077, 1.011120555310006, 0, -14.55676306143644, 1, 0.3296672504409077, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.39666416135057, 1, 0.3333333333333333, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.940904667177832, 0, 0, 0.3400314233781762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[1.377895847829273, 1.522708145322525, 0, 0, 0.4750375615156107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706],
[0.6321064381192617, 1.426988894702905, 0, 0, 0.30698259961228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06946053535683706]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1":{
"Global MG94xREV":0.0004740362202229867,
"Nucleotide GTR":0.0004591963468590921,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGG", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node100":{
"Global MG94xREV":0.0006887915978729631,
"Nucleotide GTR":0.0006672287306267833,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "T", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "ACT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1029":{
"Global MG94xREV":0.0006886079401345534,
"Nucleotide GTR":0.0006670508223595413,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGT", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1054":{
"Global MG94xREV":0.0003717615534824022,
"Nucleotide GTR":0.0003601234251287334,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAC", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1057":{
"Global MG94xREV":0.0006885993309592689,
"Nucleotide GTR":0.0006670424826975673,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "N", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAT", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1084":{
"Global MG94xREV":0.0003717796981100995,
"Nucleotide GTR":0.0003601410017323726,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "V", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GTT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1140":{
"Global MG94xREV":0.0004727618766121989,
"Nucleotide GTR":0.000457961897030678,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "Y", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "TAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1143":{
"Global MG94xREV":0.0004727618765906611,
"Nucleotide GTR":0.0004579618970098141,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "I", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ATA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1146":{
"Global MG94xREV":0.0004727354803270131,
"Nucleotide GTR":0.0004579363270906378,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "I", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ATA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1149":{
"Global MG94xREV":0.0004727354741640183,
"Nucleotide GTR":0.0004579363211205771,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "I", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ATT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node115":{
"Global MG94xREV":0.0004759614585034642,
"Nucleotide GTR":0.0004610613148668386,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAT", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1152":{
"Global MG94xREV":0.0004744958447326406,
"Nucleotide GTR":0.0004596415826591351,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "G", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GGA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1155":{
"Global MG94xREV":0.0004727354803270131,
"Nucleotide GTR":0.0004579363270906378,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "V", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GTT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node116":{
"Global MG94xREV":0.0002124361343622836,
"Nucleotide GTR":0.0002057857452203561,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAT", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1161":{
"Global MG94xREV":0.0004744958505205745,
"Nucleotide GTR":0.0004596415882658754,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "V", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "GTA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1164":{
"Global MG94xREV":0.0004727355690110127,
"Nucleotide GTR":0.0004579364129983527,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "V", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GTA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1170":{
"Global MG94xREV":0.0004727091570811155,
"Nucleotide GTR":0.0004579108279033644,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTT", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1173":{
"Global MG94xREV":0.000472709164235306,
"Nucleotide GTR":0.0004579108348335903,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "S", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1176":{
"Global MG94xREV":0.0004739823031871988,
"Nucleotide GTR":0.0004591441177153881,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "E", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "GAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1179":{
"Global MG94xREV":0.0004726965050533587,
"Nucleotide GTR":0.0004578985719518605,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "I", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ATT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1182":{
"Global MG94xREV":0.0004748345813158482,
"Nucleotide GTR":0.000459969714972492,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAC", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1185":{
"Global MG94xREV":0.0004726700922067833,
"Nucleotide GTR":0.0004578729859688906,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "V", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GTT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1188":{
"Global MG94xREV":0.0004739558411134107,
"Nucleotide GTR":0.0004591184840462817,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "A", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "GCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1191":{
"Global MG94xREV":0.0004726701026979331,
"Nucleotide GTR":0.0004578729961316115,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "V", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1194":{
"Global MG94xREV":0.0004747929802654898,
"Nucleotide GTR":0.0004599294162578893,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAC", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1197":{
"Global MG94xREV":0.0004739293789306128,
"Nucleotide GTR":0.0004590928502715776,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "C", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TGC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1203":{
"Global MG94xREV":0.0004711981580441755,
"Nucleotide GTR":0.0004564471312315278,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACT", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1206":{
"Global MG94xREV":0.0004725909561742107,
"Nucleotide GTR":0.0004577963273181122,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "S", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "TCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1209":{
"Global MG94xREV":0.0004725645117961261,
"Nucleotide GTR":0.0004577707107907384,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAT", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1212":{
"Global MG94xREV":0.000472538076624028,
"Nucleotide GTR":0.0004577451031811553,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "I", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ATC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1215":{
"Global MG94xREV":0.0004727813399640025,
"Nucleotide GTR":0.000457980751075294,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "G", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "GGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1218":{
"Global MG94xREV":0.0004724592049997726,
"Nucleotide GTR":0.0004576687006612974,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTT", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1221":{
"Global MG94xREV":0.0004727707938955593,
"Nucleotide GTR":0.0004579705351552946,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGC", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1224":{
"Global MG94xREV":0.0004753373683897117,
"Nucleotide GTR":0.0004604567621172381,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1227":{
"Global MG94xREV":0.000474228366455406,
"Nucleotide GTR":0.0004593824778850052,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTT", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1230":{
"Global MG94xREV":0.0004701143755726006,
"Nucleotide GTR":0.0004553972769577281,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAA", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1233":{
"Global MG94xREV":0.0004694087976911433,
"Nucleotide GTR":0.0004547137874441259,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "F", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TTT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node223":{
"Global MG94xREV":0.0006884117016254721,
"Nucleotide GTR":0.0006668607271671514,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTT", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node365":{
"Global MG94xREV":0.0006881147413775353,
"Nucleotide GTR":0.0006665730633659526,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGG", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node374":{
"Global MG94xREV":0.0006884519840979608,
"Nucleotide GTR":0.0006668997485824357,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node414":{
"Global MG94xREV":0.0006884312972142752,
"Nucleotide GTR":0.000666879709309041,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node473":{
"Global MG94xREV":0.0004672680719630807,
"Nucleotide GTR":0.000452640077900388,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "V", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "GTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node481":{
"Global MG94xREV":0.0006884257035417373,
"Nucleotide GTR":0.0006668742907484216,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node485":{
"Global MG94xREV":0.0004657158775396796,
"Nucleotide GTR":0.0004511364754783931,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node490":{
"Global MG94xREV":0.0006889561926728392,
"Nucleotide GTR":0.0006673881727275995,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node507":{
"Global MG94xREV":0.0006889657412366603,
"Nucleotide GTR":0.0006673974223702161,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node511":{
"Global MG94xREV":0.0006885766366616742,
"Nucleotide GTR":0.0006670204988530732,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node514":{
"Global MG94xREV":0.0006886820765464563,
"Nucleotide GTR":0.0006671226379045625,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "L", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CTA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node517":{
"Global MG94xREV":0.0006884548268909467,
"Nucleotide GTR":0.0006669025023807711,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node520":{
"Global MG94xREV":0.0006883162697172888,
"Nucleotide GTR":0.0006667682827889742,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "TTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node523":{
"Global MG94xREV":0.0006885143953051367,
"Nucleotide GTR":0.0006669602059844564,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node527":{
"Global MG94xREV":0.0006882196874382431,
"Nucleotide GTR":0.0006666747240527069,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCG", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node530":{
"Global MG94xREV":0.0006885460888107049,
"Nucleotide GTR":0.0006669909073135006,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node533":{
"Global MG94xREV":0.0006885948017334014,
"Nucleotide GTR":0.0006670380952607342,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "V", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GTA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node536":{
"Global MG94xREV":0.0006884712828635355,
"Nucleotide GTR":0.0006669184431932543,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGA", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node539":{
"Global MG94xREV":0.0006883176980359665,
"Nucleotide GTR":0.0006667696663936264,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "T", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "ACA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node542":{
"Global MG94xREV":0.000688426201523796,
"Nucleotide GTR":0.0006668747731409733,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node545":{
"Global MG94xREV":0.000688480453267458,
"Nucleotide GTR":0.000666927326514402,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "V", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GTA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548":{
"Global MG94xREV":0.0006885075791392248,
"Nucleotide GTR":0.000666953603201055,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "F", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TTT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node551":{
"Global MG94xREV":0.0006885075791392248,
"Nucleotide GTR":0.000666953603201055,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node554":{
"Global MG94xREV":0.0006887245861118475,
"Nucleotide GTR":0.0006671638166928106,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node559":{
"Global MG94xREV":0.0006886918220105364,
"Nucleotide GTR":0.0006671320782834058,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node560":{
"Global MG94xREV":0.0006888682009327252,
"Nucleotide GTR":0.0006673029356003723,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node564":{
"Global MG94xREV":0.000688649553086669,
"Nucleotide GTR":0.0006670911326033133,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTT", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node567":{
"Global MG94xREV":0.0006885347050109497,
"Nucleotide GTR":0.0006669798798876674,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node572":{
"Global MG94xREV":0.0004066799730023463,
"Nucleotide GTR":0.0003939487110406601,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node573":{
"Global MG94xREV":0.0002819529324938782,
"Nucleotide GTR":0.0002731262951309794,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node577":{
"Global MG94xREV":0.0003944822356701316,
"Nucleotide GTR":0.0003821328282368836,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node578":{
"Global MG94xREV":0.0002939727862770204,
"Nucleotide GTR":0.0002847698630937877,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node582":{
"Global MG94xREV":0.0004075044436611054,
"Nucleotide GTR":0.0003947473713506598,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node583":{
"Global MG94xREV":0.0002809037027554225,
"Nucleotide GTR":0.0002721099119046338,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node587":{
"Global MG94xREV":0.0004161407203065757,
"Nucleotide GTR":0.0004031132862678766,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node588":{
"Global MG94xREV":0.0002722918738253201,
"Nucleotide GTR":0.0002637676793583145,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node596":{
"Global MG94xREV":0.000422428132732461,
"Nucleotide GTR":0.0004092038689997296,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node597":{
"Global MG94xREV":0.0002658830890477608,
"Nucleotide GTR":0.0002575595238796528,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node605":{
"Global MG94xREV":0.0006885887054374723,
"Nucleotide GTR":0.0006670321898115307,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node614":{
"Global MG94xREV":0.0006883772112377257,
"Nucleotide GTR":0.0006668273165133251,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node617":{
"Global MG94xREV":0.0006882936464051025,
"Nucleotide GTR":0.0006667463677076656,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATT", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node620":{
"Global MG94xREV":0.0006887433611549712,
"Nucleotide GTR":0.0006671820039764959,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node624":{
"Global MG94xREV":0.0006885407422687218,
"Nucleotide GTR":0.0006669857281469258,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node627":{
"Global MG94xREV":0.0006883098751296539,
"Nucleotide GTR":0.0006667620883861925,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "A", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "GCC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node633":{
"Global MG94xREV":0.0006884626128474867,
"Nucleotide GTR":0.0006669100445951573,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node638":{
"Global MG94xREV":0.0006885197628003959,
"Nucleotide GTR":0.0006669654054483577,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "I", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node642":{
"Global MG94xREV":0.0004079013070166573,
"Nucleotide GTR":0.0003951318107569694,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node643":{
"Global MG94xREV":0.0002803127652260873,
"Nucleotide GTR":0.000271537473885942,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node653":{
"Global MG94xREV":0.0003642799837652412,
"Nucleotide GTR":0.0003528760686265741,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTG", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node659":{
"Global MG94xREV":0.0004007806453118989,
"Nucleotide GTR":0.0003882340639128438,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node660":{
"Global MG94xREV":0.0002875600524692798,
"Nucleotide GTR":0.0002785578822107468,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node665":{
"Global MG94xREV":0.001032851011698087,
"Nucleotide GTR":0.001000517241485001,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "I", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "ATA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node666":{
"Global MG94xREV":0.001034236869043658,
"Nucleotide GTR":0.001001859714070863,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "K", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "AAA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node674":{
"Global MG94xREV":0.0003766731738063868,
"Nucleotide GTR":0.0003648812854223448,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node675":{
"Global MG94xREV":0.0003117494663355845,
"Nucleotide GTR":0.0003019900378271361,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node685":{
"Global MG94xREV":0.0003729234493849432,
"Nucleotide GTR":0.0003612489474646137,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node686":{
"Global MG94xREV":0.0003154453643432377,
"Nucleotide GTR":0.0003055702344262054,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node691":{
"Global MG94xREV":0.0003732216645993467,
"Nucleotide GTR":0.0003615378269451046,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node694":{
"Global MG94xREV":0.000688358465970049,
"Nucleotide GTR":0.0006668091580729554,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node699":{
"Global MG94xREV":0.0006882475135501508,
"Nucleotide GTR":0.0006667016790582332,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node707":{
"Global MG94xREV":0.0006881817611495214,
"Nucleotide GTR":0.0006666379850600142,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGC", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node710":{
"Global MG94xREV":0.000688258326527861,
"Nucleotide GTR":0.0006667121535318094,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node713":{
"Global MG94xREV":0.000688268049859711,
"Nucleotide GTR":0.0006667215724712792,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node737":{
"Global MG94xREV":0.0006886687554110233,
"Nucleotide GTR":0.0006671097337920366,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "F", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "TTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node742":{
"Global MG94xREV":0.0003631668056115547,
"Nucleotide GTR":0.000351797738913001,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTC", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node748":{
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "S", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "TCA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node762":{
"Global MG94xREV":0.0006886304033641002,
"Nucleotide GTR":0.0006670725823696555,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node769":{
"Global MG94xREV":0.000373568452549064,
"Nucleotide GTR":0.0003618737585740635,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node770":{
"Global MG94xREV":0.0003148119315104413,
"Nucleotide GTR":0.0003049566314347211,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node783":{
"Global MG94xREV":0.0006886302794028397,
"Nucleotide GTR":0.0006670724622890466,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAT", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node790":{
"Global MG94xREV":0.0004749527065584878,
"Nucleotide GTR":0.0004600841422621745,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTT", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node798":{
"Global MG94xREV":0.0003732219379923407,
"Nucleotide GTR":0.0003615380917794333,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node799":{
"Global MG94xREV":0.0003152288022042923,
"Nucleotide GTR":0.0003053604518424508,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node804":{
"Global MG94xREV":0.0006887245632550577,
"Nucleotide GTR":0.0006671637945515594,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node807":{
"Global MG94xREV":0.0006927338223612251,
"Nucleotide GTR":0.0006710475423679145,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node813":{
"Global MG94xREV":0.0006882766179438104,
"Nucleotide GTR":0.0006667298723284431,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "G", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GGT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node820":{
"Global MG94xREV":0.0004675050426856277,
"Nucleotide GTR":0.0004528696301697385,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTT", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node821":{
"Global MG94xREV":0.0002207131901369229,
"Nucleotide GTR":0.0002138036848045409,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTT", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node833":{
"Global MG94xREV":0.0006881905230182404,
"Nucleotide GTR":0.0006666464726353014,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node842":{
"Global MG94xREV":0.0006884546795840775,
"Nucleotide GTR":0.000666902359685396,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node847":{
"Global MG94xREV":0.0006885103191001987,
"Nucleotide GTR":0.0006669562573865713,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "I", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATT", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node853":{
"Global MG94xREV":0.0004759032864794103,
"Nucleotide GTR":0.0004610049639387967,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node854":{
"Global MG94xREV":0.000212488127427859,
"Nucleotide GTR":0.0002058361106244236,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node862":{
"Global MG94xREV":0.0006884035617074017,
"Nucleotide GTR":0.0006668528420721267,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node894":{
"Global MG94xREV":0.000376838356120347,
"Nucleotide GTR":0.0003650412966449065,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node897":{
"Global MG94xREV":0.0003769039551616183,
"Nucleotide GTR":0.0003651048420847355,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node898":{
"Global MG94xREV":0.0003115110176370256,
"Nucleotide GTR":0.0003017590538503416,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node908":{
"Global MG94xREV":0.0004766707654460793,
"Nucleotide GTR":0.0004617484167020054,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node909":{
"Global MG94xREV":0.0002117077761570703,
"Nucleotide GTR":0.0002050801885291785,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node93":{
"Global MG94xREV":0.0006885441957506763,
"Nucleotide GTR":0.0006669890735163933,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node930":{
"Global MG94xREV":0.0006882106353199316,
"Nucleotide GTR":0.0006666659553141959,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "G", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GGC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node937":{
"Global MG94xREV":0.0006885123092855135,
"Nucleotide GTR":0.0006669581852684236,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "F", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "TTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node955":{
"Global MG94xREV":0.0006883276634215902,
"Nucleotide GTR":0.0006667793198092901,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "H", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "CAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655155033290845,
"Nucleotide GTR":0.0006671981547315554,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "I", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "ATT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653216447144776,
"Nucleotide GTR":0.000667003805975895,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653780229036145,
"Nucleotide GTR":0.0006670603267084268,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAG", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002068740480192789,
"Nucleotide GTR":0.0002073970965512712,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGG", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.005054559385289166,
"Nucleotide GTR":0.005067339044659958,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "E", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "S", "M", "L", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "N", "E", "T", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "-", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTA", "TTC", "TGT", "GAA", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TCG", "ATG", "CTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAT", "GAA", "ACG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "---", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413559_California_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006656853534001528,
"Nucleotide GTR":0.0006673684342418471,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413559_California_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413616_USA_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413616_USA_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006798714018427617,
"Nucleotide GTR":0.0006815903498794161,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413695_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006722455263775238,
"Nucleotide GTR":0.000673945193586034,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "-", "-", "-", "-", "IM", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "---", "---", "---", "---", "AT-", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006659798442776437,
"Nucleotide GTR":0.0006676636696932583,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCA", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "N", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAT", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000664982980597791,
"Nucleotide GTR":0.0006666642856001917,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTC", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651214813807651,
"Nucleotide GTR":0.0006668031365606385,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "M", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ATG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414522_England_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649766404385098,
"Nucleotide GTR":0.0006666579294108133,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "A", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "GCT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414522_England_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001331083435321108,
"Nucleotide GTR":0.001334448870683688,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGT", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCC", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGC", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657444181450523,
"Nucleotide GTR":0.000667427648322674,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650150776408814,
"Nucleotide GTR":0.0006666964637956127,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "V", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "GTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00133283917416554,
"Nucleotide GTR":0.001336209048637975,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "K", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "C", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAA", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGT", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652486379511662,
"Nucleotide GTR":0.0006669306146264513,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "F", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "TTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657107227682462,
"Nucleotide GTR":0.0006673938677524015,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "TTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655274774372487,
"Nucleotide GTR":0.0006672101591143714,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652177522070185,
"Nucleotide GTR":0.0006668996507925521,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "D", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "GAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657057201149595,
"Nucleotide GTR":0.0006673888524506922,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "S", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "TCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649946015873055,
"Nucleotide GTR":0.0006666759359715521,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAC", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655253075891725,
"Nucleotide GTR":0.0006672079837801749,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "S", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "TCA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665408369193315,
"Nucleotide GTR":0.0006670907497239536,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "C", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TGC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654725468100852,
"Nucleotide GTR":0.0006671550896037467,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "M", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATG", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657867828820898,
"Nucleotide GTR":0.0006674701201722948,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "I", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ATC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651903221733172,
"Nucleotide GTR":0.0006668721514063197,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTG", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001331296310676961,
"Nucleotide GTR":0.001334662284261436,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "L", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "CTT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650912705969005,
"Nucleotide GTR":0.0006667728493935522,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAC", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002154138871806631,
"Nucleotide GTR":0.0002159585273544277,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665072598590106,
"Nucleotide GTR":0.0006667541301775223,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCC", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006661880906332947,
"Nucleotide GTR":0.0006678724425671053,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATA", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655127747545283,
"Nucleotide GTR":0.0006671954192582271,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650264871145925,
"Nucleotide GTR":0.000666707902116386,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTC", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "IF", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "WTT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "I", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "TI", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATT", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "AYC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417288_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654788409185874,
"Nucleotide GTR":0.0006671613996259128,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "N", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "AAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650915782473342,
"Nucleotide GTR":0.0006667731578218305,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACC", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006656016982099453,
"Nucleotide GTR":0.0006672845675426319,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649946015873055,
"Nucleotide GTR":0.0006666759359715521,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGC", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653775397527818,
"Nucleotide GTR":0.0006670598423360234,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "L", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CTT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "MV", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "RTG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652486383125371,
"Nucleotide GTR":0.0006669306149887368,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "F", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTT", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000664982980597791,
"Nucleotide GTR":0.0006666642856001917,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGC", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650546568153117,
"Nucleotide GTR":0.0006667361430397685,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "PS", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "YCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "CF", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TKT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066540836916423,
"Nucleotide GTR":0.0006670907496947948,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "R", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CGT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654383824550064,
"Nucleotide GTR":0.0006671208388694626,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "S", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "TCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418750_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665045062496762,
"Nucleotide GTR":0.0006667265244634914,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATC", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418750_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418769_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGY", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418769_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665013391080035,
"Nucleotide GTR":0.0006666947729705631,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "F", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTT", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653574986096996,
"Nucleotide GTR":0.0006670397505220585,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGA", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000664994484981672,
"Nucleotide GTR":0.0006666758190711002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "P", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "CCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655119560708764,
"Nucleotide GTR":0.0006671945985046625,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651547862539503,
"Nucleotide GTR":0.0006668365256399632,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "G", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GGT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654725135343733,
"Nucleotide GTR":0.0006671550562439023,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTG", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006665852931451991,
"Nucleotide GTR":0.0006682706493431644,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "Q", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAA", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001331926050517779,
"Nucleotide GTR":0.001335293616300516,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "L", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "CTC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653151744427412,
"Nucleotide GTR":0.0006669973193450928,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "V", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "GTG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000664994484981672,
"Nucleotide GTR":0.0006666758190711002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "A", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GCG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "RM", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AKG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653765468221201,
"Nucleotide GTR":0.0006670588468948922,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAG", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006656510325650455,
"Nucleotide GTR":0.0006673340266318987,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "L", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CTT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "TI", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "AYT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651901385492814,
"Nucleotide GTR":0.0006668719673180191,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "I", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "ATT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657181322938703,
"Nucleotide GTR":0.0006674012960118474,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006651700714589829,
"Nucleotide GTR":0.0006668518494912352,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTG", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCY", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420210_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665491216606353,
"Nucleotide GTR":0.0006671738066036603,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "I", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ATA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420210_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655249913026114,
"Nucleotide GTR":0.0006672076666939328,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCT", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654084893413747,
"Nucleotide GTR":0.000667090870175789,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "L", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTG", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651207388898997,
"Nucleotide GTR":0.0006668023921925012,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTG", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420451_Mons_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651292418692442,
"Nucleotide GTR":0.0006668109166702934,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "R", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "AGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420451_Mons_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006659531246674257,
"Nucleotide GTR":0.0006676368825267032,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "I", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "ATT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420518_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGY", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATW", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420590_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420590_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654677510392174,
"Nucleotide GTR":0.000667150281707525,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTT", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420676_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCG", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTY", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420676_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420742_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTM", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420742_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420756_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420769_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTK", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420769_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420775_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "YTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420775_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "TI", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "AYA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTY", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "RI", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AKA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001332127013407159,
"Nucleotide GTR":0.001335495087292991,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "G", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006651516003896013,
"Nucleotide GTR":0.0006668333317206564,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "D", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GAC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653370140862362,
"Nucleotide GTR":0.0006670192142066962,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "Y", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "TAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421662_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00200107246295616,
"Nucleotide GTR":0.002006131860324659,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "Y", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TAC", "AGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TAT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421662_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655761755331013,
"Nucleotide GTR":0.0006672589803357082,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421807_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665438387919447,
"Nucleotide GTR":0.0006671208443477196,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTT", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421807_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421831_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000664982980597791,
"Nucleotide GTR":0.0006666642856001917,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "L", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "CTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421831_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421834_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655866902688948,
"Nucleotide GTR":0.0006672695216563602,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "I", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAT", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ATT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421834_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421843_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "YC", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TRC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421843_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653736183410854,
"Nucleotide GTR":0.0006670559110096537,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTT", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421847_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421848_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTR", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421848_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421851_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACY", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421851_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "TM", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "AYG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002060932047724888,
"Nucleotide GTR":0.0002066142790649964,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAC", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "AV", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GYT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006652486379511662,
"Nucleotide GTR":0.0006669306146264513,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "I", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATT", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002084839634721098,
"Nucleotide GTR":0.0002090110824224188,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "S", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "TCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654383879530315,
"Nucleotide GTR":0.0006671208443813884,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "S", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "TCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006658123634445045,
"Nucleotide GTR":0.0006674957654111428,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "V", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GTA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "YAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422436_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655156341063475,
"Nucleotide GTR":0.0006671982858394681,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "E", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GAG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649828638836496,
"Nucleotide GTR":0.0006666641685909566,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "CTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654180496057841,
"Nucleotide GTR":0.0006671004546118248,
"amino-acid": [
["K", "I", "I", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "ATT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652095402006849,
"Nucleotide GTR":0.0006668914180234505,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423181_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "AV", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GYT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423181_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423202_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002069584776618945,
"Nucleotide GTR":0.0002074817396609749,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "A", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "GCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423202_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423203_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "TA", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "RCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423203_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423210_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657741603469787,
"Nucleotide GTR":0.0006674574657230863,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "N", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "AAC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423210_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423436_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "SF", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TYT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423436_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423509_England_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006651901385492814,
"Nucleotide GTR":0.0006668719673180191,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "H", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CAC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423509_England_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "GC", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "KGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423558_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "AS", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "KCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423701_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "PL", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CYT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423701_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423719_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "AV", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GYT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423719_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423757_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "NS", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "ART", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423757_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423770_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "KN", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAW", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423770_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423784_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "SI", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "AKT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423784_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423804_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423804_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "TI", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "AYT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423814_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACW", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423833_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423855_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "PA", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "SCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423855_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654179378656385,
"Nucleotide GTR":0.0006671003425891617,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTA", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423863_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423868_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "TI", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "AYT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423868_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423906_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "SF", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TYC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423906_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423952_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002084411239120224,
"Nucleotide GTR":0.0002089681345492331,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "I", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ATT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423952_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTY", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424000_England_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0002060497732605676,
"Nucleotide GTR":0.0002065707377433204,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAC", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424000_England_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424001_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAY", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424001_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424070_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "SC", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TSC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424070_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424125_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "GC", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "KGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424125_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424131_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "AV", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GYA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424131_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "KE", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "RAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424156_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665551783706728,
"Nucleotide GTR":0.0006672345268384346,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "F", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651699380212386,
"Nucleotide GTR":0.0006668517157161138,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "S", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "AGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0006652625451652939,
"Nucleotide GTR":0.0006669445570027857,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTC", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652479230623269,
"Nucleotide GTR":0.0006669298979301282,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCA", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000664982980597791,
"Nucleotide GTR":0.0006666642856001917,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAC", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006656315402176197,
"Nucleotide GTR":0.0006673144850011348,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651607805785121,
"Nucleotide GTR":0.0006668425351202332,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "R", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CGA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006656945428168485,
"Nucleotide GTR":0.0006673776468925387,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "V", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GTA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657418971598312,
"Nucleotide GTR":0.0006674251209635379,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "H", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CAC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006687008994172589,
"Nucleotide GTR":0.0006703916045933354,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "L", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "CTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655156336845763,
"Nucleotide GTR":0.0006671982854166308,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACA", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425615_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006649944919873921,
"Nucleotide GTR":0.0006666758260945327,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATC", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425615_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002069876840772128,
"Nucleotide GTR":0.0002075110199201264,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "C", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TGC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651607740952682,
"Nucleotide GTR":0.0006668425286205964,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "V", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "GTA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665408369193315,
"Nucleotide GTR":0.0006670907497239536,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "A", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "GCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654383876460757,
"Nucleotide GTR":0.0006671208440736558,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "F", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TTT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "IL", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "WTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAY", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651607805785121,
"Nucleotide GTR":0.0006668425351202332,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCG", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "RC", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "YGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006658569916901832,
"Nucleotide GTR":0.0006675405064923301,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "C", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TGT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0006658797679363494,
"Nucleotide GTR":0.0006675633403246565,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "N", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "AAT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653314930176331,
"Nucleotide GTR":0.0006670136791789377,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "F", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "TTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006656790747907441,
"Nucleotide GTR":0.0006673621397579606,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653798667837374,
"Nucleotide GTR":0.0006670621752505109,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652487627674085,
"Nucleotide GTR":0.0006669307397582717,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "I", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATT", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "T", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "ACA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006653748926286654,
"Nucleotide GTR":0.0006670571885190699,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "GV", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GKT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006650264871520873,
"Nucleotide GTR":0.0006667079021539762,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAC", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "GV", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GKC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001330375312679846,
"Nucleotide GTR":0.001333738957665568,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "V", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "GTC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCC", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "SF", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TYT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000665548313621059,
"Nucleotide GTR":0.0006672310479791991,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "M", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATG", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427492_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006654383876460757,
"Nucleotide GTR":0.0006671208440736558,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "I", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ATT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427492_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651901328858091,
"Nucleotide GTR":0.0006668719616402274,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "S", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "AGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665206390291466,
"Nucleotide GTR":0.0006668882601501813,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "TTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655465842941177,
"Nucleotide GTR":0.0006672293142799257,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCG", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000206929298345753,
"Nucleotide GTR":0.0002074524865695168,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "E", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "GAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650916887290734,
"Nucleotide GTR":0.0006667732685829057,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "A", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GCA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665001684602733,
"Nucleotide GTR":0.0006666830368952718,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "L", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CTA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006658914860684183,
"Nucleotide GTR":0.0006675750880841821,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "Y", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "TAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653765468191056,
"Nucleotide GTR":0.0006670588468918706,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTG", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006653370140862362,
"Nucleotide GTR":0.0006670192142066962,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAT", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654190762431532,
"Nucleotide GTR":0.0006671014838448854,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCT", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649944847133835,
"Nucleotide GTR":0.0006666758188021327,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "P", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CCT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTY", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006655346934911773,
"Nucleotide GTR":0.0006672173934129586,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651607740952682,
"Nucleotide GTR":0.0006668425286205964,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTG", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429004_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTY", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429004_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429026_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649165998459718,
"Nucleotide GTR":0.000666597737015069,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "N", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAT", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAC", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429026_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429060_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAY", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429060_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651262647020003,
"Nucleotide GTR":0.0006668079319757503,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGG", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649828639214696,
"Nucleotide GTR":0.0006666641686288727,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "T", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ACC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGG", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATY", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429321_Unknown_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651406598094754,
"Nucleotide GTR":0.0006668223634789927,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTG", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429321_Unknown_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001332352512230512,
"Nucleotide GTR":0.001335721156254693,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "K", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "AAA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "K", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "AAA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429633_Washington_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653447669281126,
"Nucleotide GTR":0.0006670269866504149,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "I", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ATA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429633_Washington_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653369017188558,
"Nucleotide GTR":0.0006670191015552122,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAT", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006655155033290845,
"Nucleotide GTR":0.0006671981547315554,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCA", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653775397527818,
"Nucleotide GTR":0.0006670598423360234,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAT", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006655857565131345,
"Nucleotide GTR":0.000667268585539745,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "V", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "GTC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653370140862362,
"Nucleotide GTR":0.0006670192142066962,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "V", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GTT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655155033290845,
"Nucleotide GTR":0.0006671981547315554,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "H", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CAT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006659323105093984,
"Nucleotide GTR":0.0006676160157433475,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGA", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "AV", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GYT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGR", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654179318937653,
"Nucleotide GTR":0.0006671003366021899,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "S", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "AGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTY", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006654072408453833,
"Nucleotide GTR":0.0006670896185231717,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "V", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GTA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006651284349176613,
"Nucleotide GTR":0.0006668101076784599,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTG", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "SI", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AKT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "ML", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "MTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "ML", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "MTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "YTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657867828820898,
"Nucleotide GTR":0.0006674701201722948,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAT", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "PL", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CYA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652487627645526,
"Nucleotide GTR":0.0006669307397554079,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "C", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGT", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653594790528928,
"Nucleotide GTR":0.0006670417359724914,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649946015843546,
"Nucleotide GTR":0.0006666759359685943,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAC", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006655715952409171,
"Nucleotide GTR":0.0006672543884629758,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "I", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002080300127671659,
"Nucleotide GTR":0.0002085559839744297,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGC", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431095_Connecticut_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000664982980597791,
"Nucleotide GTR":0.0006666642856001917,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCC", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431095_Connecticut_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653368956748203,
"Nucleotide GTR":0.0006670190954958956,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "I", "TPAS", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ATA", "-CA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652486383125371,
"Nucleotide GTR":0.0006669306149887368,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTT", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAY", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432129_Wales_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006654179321840648,
"Nucleotide GTR":0.0006671003368932229,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "H", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CAT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432129_Wales_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTY", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAY", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGA", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652893487943077,
"Nucleotide GTR":0.0006669714284005644,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "I", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ATT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCS", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6":{
"Global MG94xREV":0.000664940882587942,
"Nucleotide GTR":0.0006666220811521372,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTC", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432351_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "F", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TTT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432351_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "SC", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "WGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432441_Wales_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0002068920503478516,
"Nucleotide GTR":0.0002074151443959037,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTT", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432441_Wales_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665438387919447,
"Nucleotide GTR":0.0006671208443477196,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "S", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "TCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432577_England_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432577_England_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432680_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006665218930571844,
"Nucleotide GTR":0.0006682070889579865,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "EAGV", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GNA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432680_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655282218464066,
"Nucleotide GTR":0.0006672109054056505,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "I", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432713_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657048466165515,
"Nucleotide GTR":0.0006673879767437804,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "E", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAG", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432999_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433033_England_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433033_England_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001332029831423077,
"Nucleotide GTR":0.001335397659599529,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "ILVF", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "NTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665262545429156,
"Nucleotide GTR":0.0006669445572673147,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACC", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654179321870264,
"Nucleotide GTR":0.0006671003368961919,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "T", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "ACA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006658157887970032,
"Nucleotide GTR":0.0006674991994241071,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGA", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651207388898997,
"Nucleotide GTR":0.0006668023921925012,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCG", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433421_Scotland_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002080942021389208,
"Nucleotide GTR":0.0002086203356389274,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "G", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "GGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433421_Scotland_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006654383824550064,
"Nucleotide GTR":0.0006671208388694626,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "I", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ATA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433426_Scotland_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0002084251645724474,
"Nucleotide GTR":0.0002089521348589752,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTT", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433426_Scotland_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0002058710306578325,
"Nucleotide GTR":0.0002063915432179934,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433552_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002083959811298926,
"Nucleotide GTR":0.0002089228776306706,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "V", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GTA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433552_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "L", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CTA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653370140862362,
"Nucleotide GTR":0.0006670192142066962,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "S", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "TCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652625451652939,
"Nucleotide GTR":0.0006669445570027857,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCC", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006657140312307683,
"Nucleotide GTR":0.0006673971845798512,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "M", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATG", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433733_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433875_England_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006653370140862362,
"Nucleotide GTR":0.0006670192142066962,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCT", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433875_England_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433963_England_20200412_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0002085101905685736,
"Nucleotide GTR":0.0002090373758299758,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "I", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ATC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433963_England_20200412_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655100132318338,
"Nucleotide GTR":0.0006671926507534561,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "V", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GTA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652312497911228,
"Nucleotide GTR":0.0006669131825031781,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "T", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "ACA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653368959736501,
"Nucleotide GTR":0.0006670190957954807,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAC", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654825324633657,
"Nucleotide GTR":0.0006671651005041824,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657642639750493,
"Nucleotide GTR":0.0006674475443297347,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "F", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TTT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0006655244551014233,
"Nucleotide GTR":0.0006672071291370443,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001331555162489784,
"Nucleotide GTR":0.001334921790540405,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAT", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAT", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006658784043409048,
"Nucleotide GTR":0.000667561973281574,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434480_Athens_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649946015843546,
"Nucleotide GTR":0.0006666759359685943,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGC", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434480_Athens_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651392124366254,
"Nucleotide GTR":0.0006668209124466887,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCG", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654383876460757,
"Nucleotide GTR":0.0006671208440736558,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTT", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665111817043426,
"Nucleotide GTR":0.0006667934477885399,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "A", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GCG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002084811995082643,
"Nucleotide GTR":0.0002090083114703248,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAT", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006652486383095816,
"Nucleotide GTR":0.0006669306149857739,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "L", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "TTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434664_Vastra_Gotaland_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006653370140862362,
"Nucleotide GTR":0.0006670192142066962,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAT", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434664_Vastra_Gotaland_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006652487627645526,
"Nucleotide GTR":0.0006669307397554079,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "I", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "ATT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434712_Texas_20200316_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434712_Texas_20200316_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652487584503933,
"Nucleotide GTR":0.0006669307354303424,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "L", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "TTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006658146331646121,
"Nucleotide GTR":0.0006674980408698817,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAG", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434955_Texas_20200330_null_29":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434955_Texas_20200330_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006656177946211911,
"Nucleotide GTR":0.0006673007046511252,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654084893413747,
"Nucleotide GTR":0.000667090870175789,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "Q", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAG", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002098669068523651,
"Nucleotide GTR":0.0002103975223577604,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACT", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "TI", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "AYT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "IV", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "RTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "TR", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "ASA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "PL", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CYT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "DA", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GMT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654180440245899,
"Nucleotide GTR":0.0006671004490165197,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "G", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GGT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435457_Louisiana_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006660776142991841,
"Nucleotide GTR":0.0006677616869109389,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "L", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTA", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435457_Louisiana_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651285522029497,
"Nucleotide GTR":0.0006668102252602852,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCG", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653370140862362,
"Nucleotide GTR":0.0006670192142066962,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "TTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435596_California_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "F", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "TTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435596_California_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435626_California_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001332087519226298,
"Nucleotide GTR":0.001335455493257298,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "G", "V", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GGT", "GTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435626_California_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435636_California_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001330590930683155,
"Nucleotide GTR":0.001333955120825127,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGC", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAA", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435636_California_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "DG", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GRT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "IV", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "RTA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "AV", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GYA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651044349395393,
"Nucleotide GTR":0.0006667860470201631,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAG", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTY", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAR", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435704_Connecticut_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0003057506705072357,
"Nucleotide GTR":0.0003065237130463832,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAC", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435704_Connecticut_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0006653313793089395,
"Nucleotide GTR":0.0006670135651827501,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAT", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665498082250184,
"Nucleotide GTR":0.0006671806896061941,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTA", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "KR", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "ARG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006658471856436648,
"Nucleotide GTR":0.0006675306756527638,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653314930176331,
"Nucleotide GTR":0.0006670136791789377,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "TTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650264871520873,
"Nucleotide GTR":0.0006667079021539762,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "P", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "CCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436367_Comunitat_Valenciana_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006650261179300486,
"Nucleotide GTR":0.0006667075319984174,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGC", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436367_Comunitat_Valenciana_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650264871145925,
"Nucleotide GTR":0.000666707902116386,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "T", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ACT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006658030188976195,
"Nucleotide GTR":0.0006674863972380389,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "F", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TTC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006648977178601474,
"Nucleotide GTR":0.0006665788072891097,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "L", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "CTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "YS", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TMT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "YS", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TMT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "AV", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GYT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "YF", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TWC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGR", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TMA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655057533704471,
"Nucleotide GTR":0.000667188380121679,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "I", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ATA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "TTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436596_Wisconsin_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653310746395713,
"Nucleotide GTR":0.0006670132597430736,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAT", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436596_Wisconsin_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0002083672148404499,
"Nucleotide GTR":0.0002088940386101838,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "I", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ATA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002064713653294234,
"Nucleotide GTR":0.0002069933957414931,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "V", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "GTA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "AS", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "KCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650264871520873,
"Nucleotide GTR":0.0006667079021539762,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGC", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "AG", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GST", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATY", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCK", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006650264871520873,
"Nucleotide GTR":0.0006667079021539762,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAC", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436959_LA_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653457210250194,
"Nucleotide GTR":0.0006670279431596066,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "S", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "AGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436959_LA_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436973_Unknown_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000665150207859976,
"Nucleotide GTR":0.0006668319356702388,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436973_Unknown_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653456028349048,
"Nucleotide GTR":0.0006670278246706662,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "S", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "AGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652617349556734,
"Nucleotide GTR":0.0006669437447446768,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "A", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006650264871520873,
"Nucleotide GTR":0.0006667079021539762,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAC", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066547334229668,
"Nucleotide GTR":0.0006671558871016034,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437188_Surabaya_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653456083639304,
"Nucleotide GTR":0.0006670278302136704,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "N", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "AAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437188_Surabaya_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653314927409677,
"Nucleotide GTR":0.000667013678901573,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAT", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "T", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "ACT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006654488282925329,
"Nucleotide GTR":0.0006671313111176487,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "D", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAT", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650264871520873,
"Nucleotide GTR":0.0006667079021539762,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "T", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ACC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006659340480693387,
"Nucleotide GTR":0.0006676177576964348,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATA", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006651328324888413,
"Nucleotide GTR":0.0006668145163682078,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0006655273958657442,
"Nucleotide GTR":0.000667210077336626,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "L", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "CTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651284349176613,
"Nucleotide GTR":0.0006668101076784599,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "V", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437572_California_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006651285521619979,
"Nucleotide GTR":0.0006668102252192307,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "V", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "GTT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437572_California_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437612_Thailand_20200123_null_23":{
"Global MG94xREV":0.0006654849902792275,
"Nucleotide GTR":0.0006671675645342458,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437612_Thailand_20200123_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGC", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006657746354627471,
"Nucleotide GTR":0.0006674579420401101,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437739_Madinah_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAT", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437739_Madinah_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437771_Virginia_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006653370141208111,
"Nucleotide GTR":0.0006670192142413579,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAT", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437771_Virginia_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650992725647931,
"Nucleotide GTR":0.0006667808715931633,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655054110842424,
"Nucleotide GTR":0.0006671880369700583,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "S", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "AGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655072178991225,
"Nucleotide GTR":0.0006671898483531859,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437827_Washington_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTT", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437827_Washington_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003059789034379189,
"Nucleotide GTR":0.0003067525230281777,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "V", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GTT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "TP", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "MCC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438012_Vienna_20200306_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438012_Vienna_20200306_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438038_Vienna_20200314_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATT", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438038_Vienna_20200314_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "PS", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "YCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002138277513243662,
"Nucleotide GTR":0.0002143683812027888,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "V", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "LF", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "GTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTN", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "VF", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "KTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652487584794869,
"Nucleotide GTR":0.0006669307354595091,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "F", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTT", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006653368959736501,
"Nucleotide GTR":0.0006670190957954807,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACT", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653370140862362,
"Nucleotide GTR":0.0006670192142066962,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "V", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GTT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438242_District_of_Columbia_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006653370140862362,
"Nucleotide GTR":0.0006670192142066962,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "I", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ATT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438242_District_of_Columbia_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438246_Maryland_20200318_null_65":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438246_Maryland_20200318_null_65",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006648707488957338,
"Nucleotide GTR":0.0006665517701379055,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATT", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438335_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "RG", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "RGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438335_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438337_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653368959736501,
"Nucleotide GTR":0.0006670190957954807,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTT", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438337_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438428_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCR", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438428_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438432_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649946015873055,
"Nucleotide GTR":0.0006666759359715521,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTC", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438432_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438451_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654190762431532,
"Nucleotide GTR":0.0006671014838448854,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "N", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "AAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438451_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006650264804964216,
"Nucleotide GTR":0.0006667078954814824,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAC", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438652_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438654_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653967139447155,
"Nucleotide GTR":0.0006670790650068887,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "V", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "GTA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438654_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438727_England_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006654128608860104,
"Nucleotide GTR":0.0006670952527731894,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTT", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438727_England_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438729_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651284349176613,
"Nucleotide GTR":0.0006668101076784599,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGG", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438729_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "SC", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "WGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438810_Scotland_20200401_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTT", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438810_Scotland_20200401_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTY", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652487627645526,
"Nucleotide GTR":0.0006669307397554079,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "L", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "TTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "PS", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "YCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652375741325541,
"Nucleotide GTR":0.0006669195228347122,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "C", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGT", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000665336901715889,
"Nucleotide GTR":0.0006670191015522388,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGT", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438965_Kanto_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001330645213870158,
"Nucleotide GTR":0.001334009541258642,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "A", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAC", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "GCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438965_Kanto_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "SI", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AKT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654180440245899,
"Nucleotide GTR":0.0006671004490165197,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "T", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "ACT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649946015843546,
"Nucleotide GTR":0.0006666759359685943,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCC", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654737217419519,
"Nucleotide GTR":0.0006671562675062431,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657209212397648,
"Nucleotide GTR":0.0006674040920091531,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "T", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651284349176613,
"Nucleotide GTR":0.0006668101076784599,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "A", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "GCA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650973153110533,
"Nucleotide GTR":0.0006667789093908151,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTT", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439395_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATY", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439395_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439427_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006654179321840648,
"Nucleotide GTR":0.0006671003368932229,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTA", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439427_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439444_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006653370140862362,
"Nucleotide GTR":0.0006670192142066962,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "F", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "TTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439444_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439466_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665953124238781,
"Nucleotide GTR":0.0006676368820969748,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "I", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "ATC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439466_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439512_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "AV", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GYT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439512_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439513_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTR", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439513_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_439528_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTY", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439528_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439562_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653368956748203,
"Nucleotide GTR":0.0006670190954958956,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTT", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439562_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439648_England_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006650455969376161,
"Nucleotide GTR":0.0006667270602555949,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "L", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "CTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439648_England_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439651_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "LF", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "YTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439651_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439654_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006654179321840648,
"Nucleotide GTR":0.0006671003368932229,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "I", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATA", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439654_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439661_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACY", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439661_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439664_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657380834447627,
"Nucleotide GTR":0.0006674212976060898,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTA", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439664_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439810_England_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000665564739379667,
"Nucleotide GTR":0.0006672475152677567,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTT", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439810_England_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439825_England_20200415_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439825_England_20200415_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439877_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "EG", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GRA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439877_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439878_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "RI", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AKA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439878_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439888_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006651901382516007,
"Nucleotide GTR":0.0006668719670195862,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "T", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "ACA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439888_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439903_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000664982980597791,
"Nucleotide GTR":0.0006666642856001917,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAC", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439903_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439910_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGY", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439910_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439976_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCY", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439976_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439985_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "LF", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "YTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439985_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440024_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651560389078934,
"Nucleotide GTR":0.0006668377814610459,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "F", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "TTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440024_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440043_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAY", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440043_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440056_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000664982980597791,
"Nucleotide GTR":0.0006666642856001917,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "H", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "CAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440056_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440071_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654383879530315,
"Nucleotide GTR":0.0006671208443813884,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "I", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ATT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440071_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440088_England_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006652617349556734,
"Nucleotide GTR":0.0006669437447446768,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "V", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "GTT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440088_England_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440140_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006661809795233566,
"Nucleotide GTR":0.000667865313477843,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440140_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440193_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "VF", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "KTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440193_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440223_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "SL", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TYA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440223_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440274_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAY", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440274_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440280_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAY", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440280_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440287_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAY", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440287_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440298_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652706725459643,
"Nucleotide GTR":0.0006669527049322613,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCC", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440298_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440360_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "SG", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "RGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440360_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "SI", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AKT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440384_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440411_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "YTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440411_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440415_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "PA", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "SCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440415_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440422_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652618524026267,
"Nucleotide GTR":0.0006669438624885767,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "A", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "GCA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440422_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440437_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002083672146991968,
"Nucleotide GTR":0.0002088940384685739,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "Y", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "TAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440437_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440485_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "V", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GTA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440485_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440558_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002083965336471713,
"Nucleotide GTR":0.0002089234315449019,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "I", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ATT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440558_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440561_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440561_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440577_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440577_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440580_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "RC", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "YGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440580_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440623_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTY", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440623_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440728_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006654380260925757,
"Nucleotide GTR":0.000667120481606025,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAT", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440728_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440742_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003133382478232687,
"Nucleotide GTR":0.000314130474359706,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTG", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440742_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440785_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "TI", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "AYA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440785_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440907_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440907_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441056_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657912138015098,
"Nucleotide GTR":0.0006674745622945984,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "L", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTA", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACN", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441056_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441078_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "TR", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "-", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ASA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "---", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441078_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441109_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACY", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441109_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441269_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652617352436871,
"Nucleotide GTR":0.0006669437450334193,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "R", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AGG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441269_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441277_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652617349556734,
"Nucleotide GTR":0.0006669437447446768,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "D", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441277_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441294_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002108279747999677,
"Nucleotide GTR":0.0002113610202146919,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAA", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441294_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441295_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "SG", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "RGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441295_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441311_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAY", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441311_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441321_England_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006655126584751885,
"Nucleotide GTR":0.0006671953026848929,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTA", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441321_England_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441352_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665165156065336,
"Nucleotide GTR":0.0006668469216697877,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "A", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "GCC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441352_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003139797088234555,
"Nucleotide GTR":0.0003147735571932627,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTC", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0006647855294232462,
"Nucleotide GTR":0.0006664663352013697,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTC", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441525_England_20200423_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "I", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATT", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441525_England_20200423_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441554_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "V", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GTA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441554_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441555_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "A", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "GCC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441555_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441603_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "DG", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GRT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441603_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441623_England_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441623_England_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006652617349556734,
"Nucleotide GTR":0.0006669437447446768,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTG", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441700_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "TI", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "AYA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441700_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441740_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006659531246674257,
"Nucleotide GTR":0.0006676368825267032,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTA", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441740_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441756_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTY", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441756_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441782_England_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "GC", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "KGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441782_England_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "TI", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "AYT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441798_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441832_England_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "HY", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "YAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441832_England_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00266344562897878,
"Nucleotide GTR":0.002670179732843508,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "N", "T", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441918_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442025_England_20200411_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006653313739936618,
"Nucleotide GTR":0.000667013559854033,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAT", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442025_England_20200411_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442044_Tehran_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006650264871520873,
"Nucleotide GTR":0.0006667079021539762,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGC", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442044_Tehran_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442055_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651877038968498,
"Nucleotide GTR":0.0006668695265099504,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "S", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TCA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442055_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442086_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTK", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442086_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442090_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650264871145925,
"Nucleotide GTR":0.000666707902116386,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "A", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GCA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442090_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442107_England_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442107_England_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442153_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "G", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "LF", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GGC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTK", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_442153_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442205_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAY", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442205_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442210_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAT", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442210_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442239_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649828638806199,
"Nucleotide GTR":0.0006666641685879183,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCC", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442239_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442247_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006651596070175681,
"Nucleotide GTR":0.0006668413585921241,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "I", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATT", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442247_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442261_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665160400101455,
"Nucleotide GTR":0.000666842153681199,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "G", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "GGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442261_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442271_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "GC", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "KGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442271_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442298_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTY", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442298_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442311_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTY", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442311_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442339_England_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442339_England_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442366_England_20200409_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006650725987462897,
"Nucleotide GTR":0.0006667541303340999,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "T", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ACC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442366_England_20200409_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442433_England_20200404_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000664982980597791,
"Nucleotide GTR":0.0006666642856001917,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGC", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442433_England_20200404_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442453_England_20200411_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442453_England_20200411_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442476_England_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002084251753853649,
"Nucleotide GTR":0.0002089521456992313,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "S", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442476_England_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442484_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654587057369218,
"Nucleotide GTR":0.0006671412135356036,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "I", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ATT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442484_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442553_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "HY", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "YAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442553_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442559_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "AV", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GYT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442559_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442571_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651901385492814,
"Nucleotide GTR":0.0006668719673180191,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "S", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "AGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442571_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442609_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "KN", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAW", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442609_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442635_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "AV", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GYC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442635_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442637_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653765468639535,
"Nucleotide GTR":0.0006670588469368316,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "G", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "GGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442637_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442649_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "H", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "CAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442649_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442650_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649366292878849,
"Nucleotide GTR":0.0006666178170982801,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "H", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTT", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "CAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442650_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442677_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "AV", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GYA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442677_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442721_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649728685494896,
"Nucleotide GTR":0.0006666541479851648,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCC", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442721_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442806_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650264871520873,
"Nucleotide GTR":0.0006667079021539762,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "CTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442806_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442812_England_20200407_null_54":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442812_England_20200407_null_54",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442823_England_20200411_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442823_England_20200411_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442827_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "TI", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "AYA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442827_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442847_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACK", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442847_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442884_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "TI", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "AYC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442884_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442891_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "VF", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "KTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442891_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442916_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652617349556734,
"Nucleotide GTR":0.0006669437447446768,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "R", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CGT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442916_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442933_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "DY", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "KAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442933_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442941_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGY", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442941_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442946_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "AG", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GSC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442946_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442962_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665133849567144,
"Nucleotide GTR":0.0006668155360180324,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAG", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442962_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442982_England_20200407_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006653313739936618,
"Nucleotide GTR":0.000667013559854033,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "V", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GTT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442982_England_20200407_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443008_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443008_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443035_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006653758556972503,
"Nucleotide GTR":0.0006670581540226217,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "N", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAC", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443035_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443070_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651901382516007,
"Nucleotide GTR":0.0006668719670195862,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "N", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "AAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443070_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443073_England_20200411_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "LF", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTW", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443073_England_20200411_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "IF", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "WTT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCW", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "TS", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "WCA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006654383876460757,
"Nucleotide GTR":0.0006671208440736558,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGT", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006654383876460757,
"Nucleotide GTR":0.0006671208440736558,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "I", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ATA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651607805414646,
"Nucleotide GTR":0.0006668425350830925,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCG", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443314_Ile_de_France_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002083905117115955,
"Nucleotide GTR":0.0002089173943838083,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "V", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GTT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443314_Ile_de_France_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443315_Hauts_de_France_20200402_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "F", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "TTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443315_Hauts_de_France_20200402_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654383879530315,
"Nucleotide GTR":0.0006671208443813884,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAT", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443322_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAY", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443322_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443344_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000664982980597791,
"Nucleotide GTR":0.0006666642856001917,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "H", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "CAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443344_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443365_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTY", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443365_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443378_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650725985489619,
"Nucleotide GTR":0.0006667541301362736,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTC", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443378_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443379_England_20200415_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0002064713510728534,
"Nucleotide GTR":0.0002069933814488778,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "G", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GGA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443379_England_20200415_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443381_England_20200412_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAY", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443381_England_20200412_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443384_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003010715952850853,
"Nucleotide GTR":0.0003018328075175825,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443384_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443411_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAY", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443411_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443473_England_20200414_null_39":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443473_England_20200414_null_39",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443488_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006650916956964745,
"Nucleotide GTR":0.0006667732755679236,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "A", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GCT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443488_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443492_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "AV", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GYA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443492_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443508_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "HY", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "F", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "YAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "TTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443508_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443513_England_20200415_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006649946015873055,
"Nucleotide GTR":0.0006666759359715521,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTC", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443513_England_20200415_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443578_England_20200413_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443578_England_20200413_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443592_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652011439487751,
"Nucleotide GTR":0.0006668830005429371,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAG", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443592_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443658_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006655254353742203,
"Nucleotide GTR":0.0006672081118883079,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "N", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAT", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443658_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443659_England_20200416_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "TI", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "AYA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443659_England_20200416_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443666_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "PS", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "YCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443666_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443754_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000665408369193315,
"Nucleotide GTR":0.0006670907497239536,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "A", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "GCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443754_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443766_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "NI", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "AWT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443766_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443778_England_20200330_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006653572207910976,
"Nucleotide GTR":0.0006670394720010363,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAT", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443778_England_20200330_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443780_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006652486379511662,
"Nucleotide GTR":0.0006669306146264513,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "L", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "TTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443780_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443794_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006657379566740898,
"Nucleotide GTR":0.0006674211705148982,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "S", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAY", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "AGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443794_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "PA", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "SCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443823_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443875_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006659693111827632,
"Nucleotide GTR":0.0006676531099671023,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "K", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAA", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443875_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443932_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651207388898997,
"Nucleotide GTR":0.0006668023921925012,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "S", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "AGC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443932_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443935_England_20200329_null_125":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443935_England_20200329_null_125",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443936_England_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006652495204881267,
"Nucleotide GTR":0.0006669314993947681,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCT", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443936_England_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443939_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACR", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443939_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443953_England_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "AV", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GYT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443953_England_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443959_England_20200329_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0002083904939922537,
"Nucleotide GTR":0.0002089173766196657,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "V", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443959_England_20200329_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444021_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "TI", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "AYC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444021_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444077_California_20200430_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006654179321870264,
"Nucleotide GTR":0.0006671003368961919,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAA", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444077_California_20200430_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444080_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001331142920239413,
"Nucleotide GTR":0.001334508506000265,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "T", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTT", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ACT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444080_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444128_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000665311980732931,
"Nucleotide GTR":0.0006669941175604896,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444128_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444134_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGT", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444134_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444151_England_20200409_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0002083960789329489,
"Nucleotide GTR":0.0002089229756810067,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "V", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GTT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444151_England_20200409_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444193_England_20200414_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444193_England_20200414_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444215_England_20200415_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "G", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GGC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444215_England_20200415_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444218_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654179321840648,
"Nucleotide GTR":0.0006671003368932229,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "N", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "AAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444218_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444219_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444219_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444238_England_20200418_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444238_England_20200418_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444240_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654083650736018,
"Nucleotide GTR":0.0006670907455938247,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "L", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTG", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444240_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444243_England_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006649946015873055,
"Nucleotide GTR":0.0006666759359715521,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAC", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444243_England_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444244_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006651207388898997,
"Nucleotide GTR":0.0006668023921925012,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "C", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TGC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444244_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444246_England_20200419_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444246_England_20200419_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444247_England_20200418_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006653740988888998,
"Nucleotide GTR":0.0006670563927724571,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444247_England_20200418_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444248_England_20200418_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444248_England_20200418_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444249_England_20200419_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444249_England_20200419_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444257_England_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006651285457609934,
"Nucleotide GTR":0.0006668102188020416,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "G", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GGA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444257_England_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444261_England_20200418_null_11":{
"Global MG94xREV":0.000208597011844454,
"Nucleotide GTR":0.0002091244166198132,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTT", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444261_England_20200418_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654179321840648,
"Nucleotide GTR":0.0006671003368932229,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTA", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444293_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654180496057841,
"Nucleotide GTR":0.0006671004546118248,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "I", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "ATC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444293_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444331_England_20200428_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006653370084754325,
"Nucleotide GTR":0.0006670192085817058,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "L", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TTA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444331_England_20200428_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444355_England_20200101_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444355_England_20200101_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444357_England_20200427_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0002060436068526351,
"Nucleotide GTR":0.0002065645557445942,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTT", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444357_England_20200427_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444363_England_20200429_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444363_England_20200429_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444369_England_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006655784182447847,
"Nucleotide GTR":0.0006672612287177371,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTA", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444369_England_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444373_England_20200429_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006651284414604477,
"Nucleotide GTR":0.0006668101142377881,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "G", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "GGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444373_England_20200429_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444389_England_20200428_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0002083963517691147,
"Nucleotide GTR":0.0002089232492069957,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "I", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ATA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444389_England_20200428_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444398_England_20200419_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444398_England_20200419_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444420_England_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006654383879165247,
"Nucleotide GTR":0.000667120844344789,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "I", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ATA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444420_England_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444432_England_20200420_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006662737643000244,
"Nucleotide GTR":0.0006679583328462436,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "-", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "---", "CTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444432_England_20200420_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444483_Gujarat_20200502_null_59":{
"Global MG94xREV":0.0003045368155529524,
"Nucleotide GTR":0.0003053067890505357,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444483_Gujarat_20200502_null_59",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006652328648769546,
"Nucleotide GTR":0.0006669148016724997,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444556_Illinois_20200318_null_16":{
"Global MG94xREV":0.000665319981128903,
"Nucleotide GTR":0.000667002138184206,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "F", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "TTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444556_Illinois_20200318_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006656909919837933,
"Nucleotide GTR":0.0006673740870817595,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0006657208060598551,
"Nucleotide GTR":0.0006674039765380294,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "S", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "TCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444615_New_York_20200403_null_52":{
"Global MG94xREV":0.0006653970868228343,
"Nucleotide GTR":0.0006670794388277712,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTT", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444615_New_York_20200403_null_52",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006654912162729138,
"Nucleotide GTR":0.0006671738062693779,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAC", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000665438387919447,
"Nucleotide GTR":0.0006671208443477196,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "Y", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "TAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444661_New_York_20200330_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0002115936994773096,
"Nucleotide GTR":0.0002121286809065903,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "F", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TTT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444661_New_York_20200330_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006655129255633106,
"Nucleotide GTR":0.0006671955704483061,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTA", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444787_New_York_20200414_null_1701":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444787_New_York_20200414_null_1701",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444843_Unknown_20200402_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006653945089564935,
"Nucleotide GTR":0.0006670768544437006,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444843_Unknown_20200402_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649946015873055,
"Nucleotide GTR":0.0006666759359715521,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAC", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006650451245539552,
"Nucleotide GTR":0.0006667265866775865,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATC", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006649946015873055,
"Nucleotide GTR":0.0006666759359715521,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAC", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444893_Unknown_20200309_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTT", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444893_Unknown_20200309_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006667552980903351,
"Nucleotide GTR":0.0006684410841190969,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "-", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTA", "---", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006650725987874297,
"Nucleotide GTR":0.000666754130375344,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "S", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TCC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444932_Unknown_20200328_null_279":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444932_Unknown_20200328_null_279",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006652617352436871,
"Nucleotide GTR":0.0006669437450334193,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "V", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "GTG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444964_Unknown_20200331_null_19974":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444964_Unknown_20200331_null_19974",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_61":{
"Global MG94xREV":0.0006650370742924129,
"Nucleotide GTR":0.0006667185160622227,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGC", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_61",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":13652.808718557,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02254021592892147],
[0.01128051444436367],
[0.008622247483040921],
[0.03587728326564717],
[0.01917784849325474],
[0.009597778371874262],
[0.007336050214538381],
[0.03052539980042186],
[0.01421529199243279],
[0.007114208983496559],
[0.005437736975943431],
[0.02262649386876573],
[0.02691298336892012],
[0.01346891700555902],
[0.01029495031660494],
[0.04283742138474714],
[0.01064671334204009],
[0.005328272099016637],
[0.004072658292429047],
[0.0169463838157115],
[0.00905852260105338],
[0.004533443484659063],
[0.003465132008641723],
[0.01441845909334241],
[0.00671449374726871],
[0.003360346854772943],
[0.002568477027675565],
[0.01068746612347573],
[0.01271215945807912],
[0.006361948742554809],
[0.004862747776555225],
[0.0202339563752974],
[0.0228596282273288],
[0.01144036806143875],
[0.008744431400651986],
[0.03638569212670814],
[0.01944961344373502],
[0.009733786316919322],
[0.007440007721762201],
[0.03095796833218756],
[0.01441673367791409],
[0.007215022828844555],
[0.00551479391590788],
[0.02294712879233133],
[0.02729436116503232],
[0.0136597819800282],
[0.01044083772748802],
[0.04344446078780755],
[0.01322185193245001],
[0.04205163952553338],
[0.02247828983433187],
[0.01124952280671903],
[0.008598559062535389],
[0.03577871544162399],
[0.008338539723540352],
[0.006373552686637972],
[0.02652043514139431],
[0.03154461464673246],
[0.01578687099921576],
[0.01206667562985938],
[0.05020959332223469]
],
"Log Likelihood":-6060.515067399295,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.4614103660259812, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.4927571369433988, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":764
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":14863.61158185039,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2659962599990091],
[0.1771049893250548],
[0.1873205133452973],
[0.3695782373306389]
],
"Log Likelihood":-6187.141524038389,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1461525166336857,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1799234503037074,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.04371388604911897,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.027588314889134,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.3979430214242863
},
"display order":0,
"estimated parameters":1243
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-14/sequences.nsp4.compressed.fas",
"number of sequences":619,
"number of sites":501,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1)Node1,(epi_isl_423436_England_20200330_null_1,epi_isl_444661_New_York_20200330_null_9)Node1233,(epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1,epi_isl_441294_England_20200402_null_1)Node1230,(epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_432441_Wales_20200331_null_6)Node1227,(epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4,epi_isl_442298_England_20200405_null_1)Node1224,(epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1,epi_isl_439910_England_20200324_null_1)Node1221,(epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2,epi_isl_444261_England_20200418_null_11)Node1218,(epi_isl_433421_Scotland_20200407_null_2,epi_isl_441295_England_20200402_null_1)Node1215,(epi_isl_433963_England_20200412_null_7,epi_isl_444021_England_20200326_null_2)Node1212,(epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_2,epi_isl_440280_England_20200322_null_1)Node1209,(epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1,epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1)Node1206,(epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1,epi_isl_439661_England_20200327_null_2)Node1203,epi_isl_420742_England_20200328_null_1,epi_isl_438727_England_20200426_null_2,(epi_isl_421843_England_20200324_null_1,epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2)Node1197,(epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1,epi_isl_440274_England_20200314_null_1)Node1194,(epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1,epi_isl_443959_England_20200329_null_5)Node1191,(epi_isl_423202_England_20200324_null_1,epi_isl_423203_England_20200324_null_1)Node1188,(epi_isl_423181_England_20200320_null_1,epi_isl_443314_Ile_de_France_20200414_null_2)Node1185,(epi_isl_424000_England_20200321_null_3,epi_isl_424001_England_20200319_null_1)Node1182,(epi_isl_423868_England_20200318_null_3,epi_isl_423952_England_20200319_null_1)Node1179,(epi_isl_424156_England_20200320_null_1,epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2)Node1176,(epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1,epi_isl_442476_England_20200411_null_2)Node1173,(epi_isl_433426_Scotland_20200408_null_3,epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3)Node1170,epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1,epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1,(epi_isl_433552_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1)Node1164,(epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1,epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1)Node1161,epi_isl_438451_England_20200330_null_1,epi_isl_442933_England_20200407_null_1,(epi_isl_439512_England_20200331_null_2,epi_isl_444151_England_20200409_null_10)Node1155,(epi_isl_439877_England_20200323_null_1,epi_isl_443379_England_20200415_null_4)Node1152,(epi_isl_440558_England_20200402_null_1,epi_isl_441798_England_20200403_null_1)Node1149,(epi_isl_441700_England_20200406_null_3,epi_isl_444389_England_20200428_null_5)Node1146,(epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1,epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8)Node1143,(epi_isl_440437_England_20200316_null_1,epi_isl_442553_England_20200407_null_1)Node1140,epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1,epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1,epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1,epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1,epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1,epi_isl_438337_England_20200330_null_1,epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1,epi_isl_425615_England_20200329_null_3,epi_isl_423863_England_20200317_null_1,epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1,epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1,epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1,epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1,epi_isl_434664_Vastra_Gotaland_20200406_null_2,epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_432129_Wales_20200403_null_2,epi_isl_437771_Virginia_20200414_null_2,epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1,epi_isl_438242_District_of_Columbia_20200331_null_2,epi_isl_444331_England_20200428_null_4,epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1,epi_isl_437572_California_20200421_null_2,epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1,epi_isl_444373_England_20200429_null_5,epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1,epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1,epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2,epi_isl_439654_England_20200328_null_2,epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1,epi_isl_438432_England_20200329_null_1,epi_isl_438729_England_20200426_null_1,epi_isl_444257_England_20200419_null_3,epi_isl_444293_England_20200413_null_1,epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2,epi_isl_444243_England_20200419_null_2,epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1,epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1,epi_isl_433875_England_20200408_null_3,epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1,epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1,epi_isl_444218_England_20200415_null_1,epi_isl_439562_England_20200323_null_1,epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2,epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1,epi_isl_439427_England_20200330_null_2,epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1,epi_isl_435636_California_20200311_null_1,epi_isl_439444_England_20200401_null_2,epi_isl_444077_California_20200430_null_5,epi_isl_434480_Athens_20200312_null_1,epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1,epi_isl_443513_England_20200415_null_7,(epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1,epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1)Node1084,epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4,epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1,epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2,epi_isl_423701_England_20200323_null_1,epi_isl_421917_England_20200327_null_1,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,(epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_444134_England_20200408_null_1)Node1029,epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1,epi_isl_442635_England_20200406_null_1,epi_isl_442677_England_20200405_null_1,epi_isl_440384_England_20200316_null_1,epi_isl_440415_England_20200313_null_1,epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1,epi_isl_424131_England_20200321_null_2,epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1,epi_isl_423833_England_20200323_null_1,epi_isl_423558_England_20200331_null_1,(epi_isl_435704_Connecticut_20200407_null_4,epi_isl_443794_England_20200330_null_1)Node1054,(epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1,epi_isl_429026_California_20200331_null_1)Node1057,epi_isl_423855_England_20200317_null_1,epi_isl_423906_England_20200319_null_1,epi_isl_443823_England_20200326_null_1,epi_isl_443939_England_20200326_null_1,epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1,epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1,epi_isl_438335_England_20200328_null_1,epi_isl_438428_England_20200330_null_1,epi_isl_439878_England_20200323_null_1,epi_isl_439976_England_20200320_null_1,epi_isl_442941_England_20200407_null_1,epi_isl_442946_England_20200408_null_1,epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1,epi_isl_442205_England_20200407_null_1,epi_isl_442271_England_20200406_null_1,epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1,epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1,epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1,epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2,epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1,((epi_isl_432999_England_20200402_null_1,epi_isl_442210_England_20200403_null_2)Node116,epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1)Node115,epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1,epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1,epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1,epi_isl_443780_England_20200327_null_2,epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5,epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1,epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1,epi_isl_421807_England_20200325_null_1,epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2,epi_isl_441277_England_20200402_null_1,epi_isl_423509_England_20200331_null_6,epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1,epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1,epi_isl_444964_Unknown_20200331_null_19974,epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2,epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1,epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1,epi_isl_444244_England_20200419_null_1,epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2,epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1,epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1,epi_isl_443936_England_20200326_null_3,epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7,epi_isl_440088_England_20200321_null_3,epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1,epi_isl_440422_England_20200317_null_1,epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_5,epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1,epi_isl_442090_England_20200406_null_1,(epi_isl_435457_Louisiana_20200402_null_1,epi_isl_437827_Washington_20200331_null_6)Node223,epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1,epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1,epi_isl_442366_England_20200409_null_5,epi_isl_443932_England_20200326_null_1,epi_isl_444420_England_20200419_null_3,epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1,epi_isl_442044_Tehran_20200326_null_3,epi_isl_431095_Connecticut_20200410_null_1,epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1,epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1,epi_isl_427492_New_York_20200401_null_2,epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1,epi_isl_443378_England_20200416_null_1,epi_isl_421831_England_20200323_null_3,epi_isl_439466_England_20200401_null_1,epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3,epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4,epi_isl_440298_England_20200314_null_1,epi_isl_441269_England_20200402_null_1,epi_isl_443344_England_20200416_null_2,epi_isl_441740_England_20200406_null_3,epi_isl_442982_England_20200407_null_6,epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1,epi_isl_442806_England_20200404_null_1,epi_isl_443754_England_20200326_null_1,epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1,epi_isl_442916_England_20200408_null_1,epi_isl_443658_England_20200417_null_2,epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1,epi_isl_444240_England_20200418_null_1,epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_3,epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1,epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1,epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1,epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1,epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1,epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1,epi_isl_443070_England_20200411_null_1,epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1,epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4,epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1,epi_isl_436077_New_York_20200319_null_8,epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1,epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1,epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2,epi_isl_414482_USA_20200218_null_1,epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1,epi_isl_436367_Comunitat_Valenciana_20200325_null_2,epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1,epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1,epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1,epi_isl_439888_England_20200323_null_2,epi_isl_420518_England_20200323_null_1,epi_isl_436959_LA_20200405_null_1,epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1,epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1,epi_isl_438652_England_20200423_null_2,epi_isl_440071_England_20200319_null_1,epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_442025_England_20200411_null_4,epi_isl_440056_England_20200321_null_2,epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1,epi_isl_440728_England_20200405_null_2,epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1,epi_isl_439903_England_20200401_null_1,epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1,epi_isl_436596_Wisconsin_20200413_null_1,epi_isl_442261_England_20200407_null_1,epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3,epi_isl_442433_England_20200404_null_4,epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1,epi_isl_437188_Surabaya_20200414_null_1,epi_isl_442239_England_20200406_null_1,epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2,epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_1,epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1,epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1,(epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1,epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1)Node365,epi_isl_444843_Unknown_20200402_null_11,epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1,epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14,(epi_isl_443008_England_20200407_null_2,epi_isl_444247_England_20200418_null_3)Node374,epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2,epi_isl_444556_Illinois_20200318_null_16,(epi_isl_435626_California_20200307_null_1,epi_isl_443953_England_20200330_null_7,epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3,epi_isl_444246_England_20200419_null_28)Node605,((epi_isl_437612_Thailand_20200123_null_23,epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_8,epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1,epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1)Node597,epi_isl_443411_England_20200415_null_1)Node596,((epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1,epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3,epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1,epi_isl_441603_England_20200406_null_1)Node588,epi_isl_440287_England_20200321_null_2)Node587,((epi_isl_420590_New_York_20200318_null_1,epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1)Node583,epi_isl_421851_England_20200327_null_1)Node582,((epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_444248_England_20200418_null_4)Node578,epi_isl_420775_England_20200330_null_1)Node577,((epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1,epi_isl_442453_England_20200411_null_20)Node573,epi_isl_443073_England_20200411_null_7)Node572,(epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1,epi_isl_421665_India_20200310_null_1,epi_isl_440561_England_20200402_null_1)Node567,(epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1,epi_isl_438810_Scotland_20200401_null_8)Node564,((epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1,epi_isl_438246_Maryland_20200318_null_65)Node560,epi_isl_442339_England_20200407_null_5)Node559,(epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1,epi_isl_440577_England_20200402_null_2,epi_isl_442637_England_20200407_null_1)Node554,(epi_isl_420756_England_20200327_null_2,epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1)Node551,(epi_isl_432351_Wales_20200331_null_1,epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1)Node548,(epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1,epi_isl_440485_England_20200311_null_1)Node545,(epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2,epi_isl_441623_England_20200405_null_5)Node542,(epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1)Node539,(epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1,epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1)Node536,(epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2,epi_isl_441554_England_20200406_null_2)Node533,(epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2,epi_isl_439825_England_20200415_null_16)Node530,(epi_isl_420676_England_20200328_null_1,epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1)Node527,epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2,(epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1,epi_isl_434283_Washington_20200326_null_2)Node523,(epi_isl_415600_USA_20200309_null_1,epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1)Node520,(epi_isl_414619_USA_20200307_null_1,epi_isl_442107_England_20200405_null_5)Node517,(epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1)Node514,((epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1,epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1)Node485,epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1,epi_isl_429060_California_20200331_null_1,epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1,(epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14,epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1)Node481,epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1,epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1,epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_444787_New_York_20200414_null_1701,epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1,epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1,epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1,epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1,epi_isl_413695_China_20200101_null_1,epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1,epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1,(epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1,epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4)Node473,epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1,epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15,epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1,epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1,epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1,epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1,epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1,epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1,epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1,epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2,epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1,epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2,epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1,epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9,epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2,(epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1,epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2,epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1,epi_isl_444932_Unknown_20200328_null_279,epi_isl_439651_England_20200325_null_1,epi_isl_440043_England_20200313_null_1,epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1,epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1,epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1)Node490,(epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1,epi_isl_440140_England_20200315_null_1)Node507)Node414,(epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5,epi_isl_444238_England_20200418_null_4)Node511,(epi_isl_413616_USA_20200217_null_1,epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2)Node620,(epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1,epi_isl_444193_England_20200414_null_10)Node614,(epi_isl_438038_Vienna_20200314_null_5,epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1)Node617,(epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15,epi_isl_444219_England_20200415_null_1)Node624,(epi_isl_441352_England_20200420_null_1,epi_isl_441555_England_20200405_null_1)Node627,((epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8)Node643,epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4)Node642,epi_isl_443365_England_20200415_null_2,(epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1,epi_isl_442891_England_20200407_null_1,epi_isl_443473_England_20200414_null_39)Node633,(epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1,epi_isl_432713_England_20200325_null_1)Node638,((epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1,epi_isl_438012_Vienna_20200306_null_8)Node660,epi_isl_440411_England_20200312_null_1)Node659,(epi_isl_440742_England_20200403_null_2,epi_isl_444432_England_20200420_null_5)Node653,epi_isl_444128_England_20200408_null_4,epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1,((epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1,epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4)Node666,epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1)Node665,epi_isl_442055_England_20200406_null_1,epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2,((epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4,epi_isl_443935_England_20200329_null_125,epi_isl_440360_England_20200321_null_1,epi_isl_439810_England_20200413_null_2,epi_isl_443666_England_20200413_null_1)Node675,epi_isl_443381_England_20200412_null_8)Node674,((epi_isl_432680_England_20200406_null_1,epi_isl_443578_England_20200413_null_6)Node686,epi_isl_440223_England_20200321_null_1)Node685,(epi_isl_443659_England_20200416_null_7,epi_isl_444483_Gujarat_20200502_null_59)Node691,(epi_isl_423804_England_20200324_null_2,epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1)Node694,(epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1,(epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5,epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17,(epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1,epi_isl_414522_England_20200228_null_1)Node713,epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1)Node710,(epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1,epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_61)Node707,epi_isl_441782_England_20200407_null_7,epi_isl_444363_England_20200429_null_4,epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1)Node699,epi_isl_436973_Unknown_20200328_null_2,epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1,epi_isl_443592_England_20200412_null_1,epi_isl_420210_England_20200327_null_1,epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1,epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1,epi_isl_441321_England_20200401_null_3,epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1,epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1,epi_isl_440024_England_20200322_null_1,(epi_isl_435596_California_20200304_null_2,epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_440193_England_20200321_null_1)Node737,(epi_isl_423967_England_20200320_null_1,epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1)Node742,epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1,epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_10,epi_isl_442962_England_20200407_null_1,epi_isl_443035_England_20200410_null_1,(epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2)Node762,epi_isl_442247_England_20200405_null_2,epi_isl_443488_England_20200415_null_2,epi_isl_442721_England_20200405_null_1,((epi_isl_443875_England_20200330_null_1,epi_isl_444369_England_20200428_null_2,epi_isl_438654_England_20200423_null_1,epi_isl_444398_England_20200419_null_28)Node770,epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1)Node769,epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1,epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1,(epi_isl_421834_England_20200326_null_1,epi_isl_437739_Madinah_20200420_null_1)Node783,epi_isl_439664_England_20200330_null_1,epi_isl_420451_Mons_20200307_null_1,(epi_isl_442086_England_20200405_null_1,epi_isl_444357_England_20200427_null_5)Node790,epi_isl_442484_England_20200331_null_1,epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_421847_England_20200326_null_1,((epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1,epi_isl_440907_England_20200420_null_1)Node799,epi_isl_439985_England_20200322_null_1)Node798,(epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1,epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1,(epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1)Node807,epi_isl_434955_Texas_20200330_null_29)Node804,(epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1)Node813,epi_isl_439648_England_20200322_null_4,((epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6,epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1,epi_isl_444893_Unknown_20200309_null_5)Node821,epi_isl_420769_England_20200331_null_1)Node820,epi_isl_429321_Unknown_20200316_null_1,epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1,epi_isl_442571_England_20200410_null_1,(epi_isl_417288_England_20200305_null_1,epi_isl_441525_England_20200423_null_4)Node847,(epi_isl_418750_England_20200318_null_1,epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1,epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1,epi_isl_421662_India_20200310_null_1,epi_isl_442812_England_20200407_null_54)Node833,(epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_433033_England_20200403_null_3,epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1)Node842,((epi_isl_433733_England_20200405_null_2,epi_isl_442823_England_20200411_null_15)Node854,epi_isl_439395_England_20200331_null_2)Node853,epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1,epi_isl_443778_England_20200330_null_5,(epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1,epi_isl_434712_Texas_20200316_null_10)Node862,epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1,epi_isl_423210_England_20200327_null_1,epi_isl_442884_England_20200407_null_1,epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1,epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1,epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_423757_England_20200324_null_1,epi_isl_421848_England_20200327_null_1,epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1,epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1,epi_isl_418769_England_20200318_null_1,(epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_443384_England_20200414_null_2)Node894,((epi_isl_413559_California_20200227_null_1,epi_isl_444355_England_20200101_null_12)Node898,epi_isl_443492_England_20200414_null_2)Node897,epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_12,epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1,epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1,epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1,((epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1,epi_isl_432577_England_20200403_null_3)Node909,epi_isl_439528_England_20200401_null_1)Node908,epi_isl_423719_England_20200323_null_1,epi_isl_441832_England_20200403_null_4,epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2,epi_isl_442609_England_20200408_null_1,(epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1,epi_isl_444249_England_20200419_null_16,epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1,epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1)Node93,(epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2,epi_isl_441918_England_20200410_null_1)Node100,epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1,epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1,epi_isl_441311_England_20200402_null_1,epi_isl_429633_Washington_20200406_null_1,epi_isl_441078_England_20200403_null_1,(epi_isl_442153_England_20200406_null_1,epi_isl_444215_England_20200415_null_5)Node930,epi_isl_439513_England_20200331_null_1,epi_isl_442311_England_20200407_null_1,(epi_isl_443315_Hauts_de_France_20200402_null_9,epi_isl_443508_England_20200413_null_1)Node937,epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2,epi_isl_442559_England_20200412_null_1,epi_isl_440623_England_20200402_null_1,epi_isl_423784_England_20200322_null_1,epi_isl_444080_England_20200404_null_1,epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1,epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1,epi_isl_429004_California_20200328_null_1,(epi_isl_442649_England_20200407_null_2,epi_isl_442650_England_20200406_null_1)Node955,epi_isl_444615_New_York_20200403_null_52,epi_isl_423814_England_20200323_null_1,epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1,epi_isl_441056_England_20200403_null_1,epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1,epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1,epi_isl_442827_England_20200407_null_1,epi_isl_442847_England_20200408_null_1,epi_isl_440580_England_20200403_null_1,epi_isl_440785_England_20200402_null_1,epi_isl_424070_England_20200321_null_1,epi_isl_424125_England_20200311_null_1,epi_isl_423770_England_20200322_null_1,epi_isl_422436_England_20200327_null_1,epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1,epi_isl_438965_Kanto_20200403_null_1,epi_isl_443322_England_20200412_null_1,epi_isl_443766_England_20200328_null_1,epi_isl_441109_England_20200402_null_2,epi_isl_441756_England_20200405_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1":"test",
"Node100":"test",
"Node1029":"test",
"Node1054":"test",
"Node1057":"test",
"Node1084":"test",
"Node1140":"test",
"Node1143":"test",
"Node1146":"test",
"Node1149":"test",
"Node115":"test",
"Node1152":"test",
"Node1155":"test",
"Node116":"test",
"Node1161":"test",
"Node1164":"test",
"Node1170":"test",
"Node1173":"test",
"Node1176":"test",
"Node1179":"test",
"Node1182":"test",
"Node1185":"test",
"Node1188":"test",
"Node1191":"test",
"Node1194":"test",
"Node1197":"test",
"Node1203":"test",
"Node1206":"test",
"Node1209":"test",
"Node1212":"test",
"Node1215":"test",
"Node1218":"test",
"Node1221":"test",
"Node1224":"test",
"Node1227":"test",
"Node1230":"test",
"Node1233":"test",
"Node223":"test",
"Node365":"test",
"Node374":"test",
"Node414":"test",
"Node473":"test",
"Node481":"test",
"Node485":"test",
"Node490":"test",
"Node507":"test",
"Node511":"test",
"Node514":"test",
"Node517":"test",
"Node520":"test",
"Node523":"test",
"Node527":"test",
"Node530":"test",
"Node533":"test",
"Node536":"test",
"Node539":"test",
"Node542":"test",
"Node545":"test",
"Node548":"test",
"Node551":"test",
"Node554":"test",
"Node559":"test",
"Node560":"test",
"Node564":"test",
"Node567":"test",
"Node572":"test",
"Node573":"test",
"Node577":"test",
"Node578":"test",
"Node582":"test",
"Node583":"test",
"Node587":"test",
"Node588":"test",
"Node596":"test",
"Node597":"test",
"Node605":"test",
"Node614":"test",
"Node617":"test",
"Node620":"test",
"Node624":"test",
"Node627":"test",
"Node633":"test",
"Node638":"test",
"Node642":"test",
"Node643":"test",
"Node653":"test",
"Node659":"test",
"Node660":"test",
"Node665":"test",
"Node666":"test",
"Node674":"test",
"Node675":"test",
"Node685":"test",
"Node686":"test",
"Node691":"test",
"Node694":"test",
"Node699":"test",
"Node707":"test",
"Node710":"test",
"Node713":"test",
"Node737":"test",
"Node742":"test",
"Node762":"test",
"Node769":"test",
"Node770":"test",
"Node783":"test",
"Node790":"test",
"Node798":"test",
"Node799":"test",
"Node804":"test",
"Node807":"test",
"Node813":"test",
"Node820":"test",
"Node821":"test",
"Node833":"test",
"Node842":"test",
"Node847":"test",
"Node853":"test",
"Node854":"test",
"Node862":"test",
"Node894":"test",
"Node897":"test",
"Node898":"test",
"Node908":"test",
"Node909":"test",
"Node93":"test",
"Node930":"test",
"Node937":"test",
"Node955":"test",
"epi_isl_402123_Hubei_20191224_null_1":"background",
"epi_isl_402130_Hubei_20191230_null_1":"background",
"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1":"background",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"background",
"epi_isl_413559_California_20200227_null_1":"background",
"epi_isl_413616_USA_20200217_null_1":"background",
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":"background",
"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_414522_England_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"background",
"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1":"background",
"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1":"background",
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1":"background",
"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1":"background",
"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1":"background",
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":"background",
"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2":"background",
"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"background",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_418117_Wales_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418750_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418769_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1":"background",
"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":"background",
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_420210_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_420451_Mons_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_420536_Western_Australia_20200315_null_2":"background",
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_420590_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_420676_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420742_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_420769_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_420775_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":"background",
"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421662_India_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_421807_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_421831_England_20200323_null_3":"background",
"epi_isl_421834_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421843_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421848_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421851_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_423181_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_423202_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423203_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423210_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_423436_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423509_England_20200331_null_6":"background",
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423701_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423719_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423757_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423770_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423784_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423804_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423855_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_423868_England_20200318_null_3":"background",
"epi_isl_423906_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423952_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424000_England_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_424001_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_424070_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424125_England_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_424131_England_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15":"background",
"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2":"background",
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_425615_England_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_426044_New_York_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14":"background",
"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14":"background",
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_426718_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4":"background",
"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8":"background",
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_427492_New_York_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_427684_New_South_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427731_New_South_Wales_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4":"background",
"epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_429004_California_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429026_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429060_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_429321_Unknown_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_429633_Washington_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_429982_Virginia_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1":"background",
"epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_431095_Connecticut_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_432129_Wales_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6":"background",
"epi_isl_432351_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_432441_Wales_20200331_null_6":"background",
"epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432577_England_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_432680_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433033_England_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_433421_Scotland_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_433424_Scotland_20200408_null_5":"background",
"epi_isl_433426_Scotland_20200408_null_3":"background",
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4":"background",
"epi_isl_433552_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_433875_England_20200408_null_3":"background",
"epi_isl_433963_England_20200412_null_7":"background",
"epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434283_Washington_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15":"background",
"epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_434480_Athens_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_434664_Vastra_Gotaland_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2":"background",
"epi_isl_434712_Texas_20200316_null_10":"background",
"epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_434955_Texas_20200330_null_29":"background",
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5":"background",
"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4":"background",
"epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_435457_Louisiana_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_435596_California_20200304_null_2":"background",
"epi_isl_435626_California_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_435636_California_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3":"background",
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_435704_Connecticut_20200407_null_4":"background",
"epi_isl_436077_New_York_20200319_null_8":"background",
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_436367_Comunitat_Valenciana_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_436596_Wisconsin_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8":"background",
"epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2":"background",
"epi_isl_436959_LA_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436973_Unknown_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_436997_Unknown_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3":"background",
"epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437188_Surabaya_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17":"background",
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5":"background",
"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_12":"background",
"epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_437572_California_20200421_null_2":"background",
"epi_isl_437612_Thailand_20200123_null_23":"background",
"epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_437739_Madinah_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_437771_Virginia_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_437827_Washington_20200331_null_6":"background",
"epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_437918_Ischgl_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_438012_Vienna_20200306_null_8":"background",
"epi_isl_438038_Vienna_20200314_null_5":"background",
"epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4":"background",
"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_438242_District_of_Columbia_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_438246_Maryland_20200318_null_65":"background",
"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_438335_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_438337_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438428_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438432_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438451_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_438654_England_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_438727_England_20200426_null_2":"background",
"epi_isl_438729_England_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_438810_Scotland_20200401_null_8":"background",
"epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_438965_Kanto_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_439230_Scotland_20200424_null_8":"background",
"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1":"background",
"epi_isl_439395_England_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_439427_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_439444_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_439466_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_439512_England_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_439513_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439528_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_439562_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439648_England_20200322_null_4":"background",
"epi_isl_439651_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_439654_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_439661_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_439664_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_439810_England_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_439825_England_20200415_null_16":"background",
"epi_isl_439877_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439878_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439888_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_439903_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_439910_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_439976_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_439985_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440024_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440043_England_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_440056_England_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_440071_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_440088_England_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_440140_England_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_440193_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440223_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440274_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440280_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440287_England_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_440298_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440360_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_440411_England_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_440415_England_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_440422_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_440437_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_440485_England_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_440558_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440561_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440577_England_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_440580_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_440623_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440728_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_440742_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_440785_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440907_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_441056_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441078_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441109_England_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_441269_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441277_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441294_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441295_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441311_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441321_England_20200401_null_3":"background",
"epi_isl_441352_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_10":"background",
"epi_isl_441525_England_20200423_null_4":"background",
"epi_isl_441554_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_441555_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_441603_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441623_England_20200405_null_5":"background",
"epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_441700_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_441740_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_441756_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_441782_England_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441832_England_20200403_null_4":"background",
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442025_England_20200411_null_4":"background",
"epi_isl_442044_Tehran_20200326_null_3":"background",
"epi_isl_442055_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442086_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442090_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442107_England_20200405_null_5":"background",
"epi_isl_442153_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442205_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442210_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_442239_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442247_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_442261_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442271_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442298_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442311_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442339_England_20200407_null_5":"background",
"epi_isl_442366_England_20200409_null_5":"background",
"epi_isl_442433_England_20200404_null_4":"background",
"epi_isl_442453_England_20200411_null_20":"background",
"epi_isl_442476_England_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_442484_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_442553_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442559_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_442571_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442609_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442635_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442637_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442649_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_442650_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442677_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442721_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442806_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442812_England_20200407_null_54":"background",
"epi_isl_442823_England_20200411_null_15":"background",
"epi_isl_442827_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442847_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442884_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442891_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442916_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442933_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442941_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442946_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442962_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442982_England_20200407_null_6":"background",
"epi_isl_443008_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_443035_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_443070_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443073_England_20200411_null_7":"background",
"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4":"background",
"epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4":"background",
"epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_443314_Ile_de_France_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443315_Hauts_de_France_20200402_null_9":"background",
"epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_443322_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443344_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443365_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_443378_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_443379_England_20200415_null_4":"background",
"epi_isl_443381_England_20200412_null_8":"background",
"epi_isl_443384_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443411_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_443473_England_20200414_null_39":"background",
"epi_isl_443488_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_443492_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443508_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_443513_England_20200415_null_7":"background",
"epi_isl_443578_England_20200413_null_6":"background",
"epi_isl_443592_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443658_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_443659_England_20200416_null_7":"background",
"epi_isl_443666_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_443754_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443766_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_443778_England_20200330_null_5":"background",
"epi_isl_443780_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_443794_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443875_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443932_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443935_England_20200329_null_125":"background",
"epi_isl_443936_England_20200326_null_3":"background",
"epi_isl_443939_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443953_England_20200330_null_7":"background",
"epi_isl_443959_England_20200329_null_5":"background",
"epi_isl_444021_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_444077_California_20200430_null_5":"background",
"epi_isl_444080_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_444128_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_444134_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_444151_England_20200409_null_10":"background",
"epi_isl_444193_England_20200414_null_10":"background",
"epi_isl_444215_England_20200415_null_5":"background",
"epi_isl_444218_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444219_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444238_England_20200418_null_4":"background",
"epi_isl_444240_England_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_444243_England_20200419_null_2":"background",
"epi_isl_444244_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_444246_England_20200419_null_28":"background",
"epi_isl_444247_England_20200418_null_3":"background",
"epi_isl_444248_England_20200418_null_4":"background",
"epi_isl_444249_England_20200419_null_16":"background",
"epi_isl_444257_England_20200419_null_3":"background",
"epi_isl_444261_England_20200418_null_11":"background",
"epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444293_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_444331_England_20200428_null_4":"background",
"epi_isl_444355_England_20200101_null_12":"background",
"epi_isl_444357_England_20200427_null_5":"background",
"epi_isl_444363_England_20200429_null_4":"background",
"epi_isl_444369_England_20200428_null_2":"background",
"epi_isl_444373_England_20200429_null_5":"background",
"epi_isl_444389_England_20200428_null_5":"background",
"epi_isl_444398_England_20200419_null_28":"background",
"epi_isl_444420_England_20200419_null_3":"background",
"epi_isl_444432_England_20200420_null_5":"background",
"epi_isl_444483_Gujarat_20200502_null_59":"background",
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_444556_Illinois_20200318_null_16":"background",
"epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9":"background",
"epi_isl_444615_New_York_20200403_null_52":"background",
"epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3":"background",
"epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5":"background",
"epi_isl_444661_New_York_20200330_null_9":"background",
"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444787_New_York_20200414_null_1701":"background",
"epi_isl_444843_Unknown_20200402_null_11":"background",
"epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_444893_Unknown_20200309_null_5":"background",
"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_444932_Unknown_20200328_null_279":"background",
"epi_isl_444943_Unknown_20200328_null_3":"background",
"epi_isl_444964_Unknown_20200331_null_19974":"background",
"epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_61":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":52
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":13
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":66
}
}
}